Genomic resources for the brown planthopper, Nilaparvata lugens: Transcriptome pyrosequencing and microarray design

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摘要 棕色的planthopper,Nilaparvatalugens是在整个亚洲的栽培米饭的一个害虫并且用杀虫药剂或抵抗米饭变化被控制。这种开发了抵抗到杀虫药剂的许多班,遗传因子型开发了那对先前是剧毒的抵抗米饭栽培变种。昆虫使用detoxification酶的一间套房,包括保卫自己对的细胞色素P450s,谷胱甘肽S-transferases和carboxyl/cholinesterases种第二等的代谢物和杀虫剂。Roche454-FLX站台上的Pyrosequencing被用来生产补充存在Sanger的数据集定序的一个实质的表示顺序标签(EST)在GenBank的EST。一个总数78959读与37392公开地可得到的SangerEST被相结合;这些集合了进8911contigs和10620单条。分发的分析试验有为生物进程和分子的函数的基因本体论的唯一的基因(拖船)建议454并且SangerEST汇编N是广泛地代表性的。lugenstranscriptome。planthoppertranscriptome被发现包含编码P450s,九个编码谷胱甘肽S-transferases和这些的26编码carboxyl/cholinesterases和许多的31条拖船的褐通常认为地涉及xenobiotics的detoxification。AgilenteArray站台被用来构造为19000个unigene序列与探针占据的oligonucleotidemicroarray,包括知道编码detoxification酶的所有那些。在这研究开发的genomic资源将对学习这个庄稼害虫的社区有用并且将帮助阐明位于杀虫药剂抵抗和planthopper改编下面到抵抗米饭栽培变种的分子的机制。
机构地区 不详
出处 《昆虫科学:英文版》 2012年1期
出版日期 2012年01月11日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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