摘要
摘要目的研究2015—2018年上海市普陀区手足口病病原谱，并对鉴定为柯萨奇病毒A6型（coxsackievirus A6，CVA6）的VP1基因特征进行分析，以掌握本地区CVA6的分子流行病学特征。方法采用实时荧光定量PCR法对收集的标本进行肠道病毒通用基因和分型基因检测，对鉴定为CVA6型病毒进行VP1基因测序并分析。结果2015—2018年共检测943份手足口标本，肠道病毒通用基因阳性522份（55.36%），其中CVA6阳性332份（63.60%），柯萨奇病毒A16型（coxsackievirus A16，CVA16）阳性110份（21.07%），肠道病毒71型（enterovirus 71，EV71）阳性56份（10.73%），柯萨奇病毒A10型（coxsackievirus A10，CVA10）阳性11份（2.11%），其他肠道病毒13份（2.49%）。20株CVA6型病毒的VP1基因之间核苷酸同源性为92.9%~100.0%，氨基酸同源性为98.4%~100.0%，都属于D3亚型。结论2015—2018年上海市普陀地区引起手足口病的病原体主要有CVA6、CVA16、EV71和CVA10，CVA6已成为上海市普陀地区手足口病的主要病原体，其中优势基因型为D3亚型。
出版日期
2020年08月10日（中国期刊网平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
