简介:高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。
简介:我国地处北纬35°以北和海拔千米以上国土,约占全国总面积的75%,在这广大的高纬度或高海拔地带的山区,林区河流、湖泊,多属水温常年偏低的冷水水域。其中栖息的冷水性或喜冷性鱼类初步统计有56种,隶属于11科30属。其主要经济种类有七鳃鳗科、鲟科、鲑科、茴鱼科、胡瓜鱼科、狗鱼科、鲤科及鳕科等8科中的20种。冷水性鱼类的特点为:对生态环境有其特定要求,常年生活在水温不超过20°、水质澄清、底质砂砾、砾石,溶氧含量较高的山林区流水水域;繁殖水温多在16℃以下;种群数量小,地区分布不平衡,肉食性种类多,生长速度快,肉质好,多属名特优鱼品。受种种原因的影响,现存冷水性鱼类种群数量减少趋势明显,有的种类已成珍稀或濒危状态。为了保护和增殖我国贵重的冷水性鱼类种质资源,并进而对若干经济种类逐步开发利用,经过调查,提出了在黑龙江省宁安县钻心湖建立冷水性鱼类天然种质资源库的可行性考察报告,阐述了多种主要冷水性鱼类的特性;钻心湖的水域环境基本情况,现有的基础条件,建库的规划设想及其经营方式与效益予测。供有关郎门参考。