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  • 简介:摘要目的研究拉沙病毒(Lassa virus,LASV)密码使用偏性及其偏性形成的影响因素,比较LASV和几种表达系统密码使用频率,为LASV重组亚单位疫苗、mRNA疫苗、DNA疫苗等基因工程疫苗的制备筛选出最优外源表达系统。方法使用Excel 2007、EMBOSS、CondonW1.4.2、SigmaPlot 14.0、SPSS 22.0等软件分析LASV核心蛋白(nucleoprotein,N)、包膜糖蛋白(envelope glycoproteins,G)、锌结合蛋白(zinc-binding protein,Z)、RNA聚合酶(RNA polymerase,L)蛋白共446条基因序列的密码偏性及其影响因素,并将LASV密码使用模式与几种不同表达系统进行比较。结果LASV的各蛋白编码序列的各位置GC含量存在较大差异,各蛋白平均GC3含量为42.29%~59.47%,ENC均值41.73~52.81,除Z蛋白密码偏性较强外,N、G、L三种蛋白密码偏性较弱。4种蛋白RSCU>1的密码共108个,约占45.76%,其中以A/U结尾占63.9%,GUU、GUG、UCU、UCA、CCU、ACA、GCU、GCA、AGA、AGG为LASV多数蛋白的高频,GCA、AGA为4种蛋白共有的高频。ENC-Plot、中性分析、PR2绘图分析显示,LASV的各蛋白密码使用偏性受到不同因素影响,其主要因素是自然选择,突变是次要原因。对比分析提示人和酵母菌是LASV较合适的外源表达系统。结论LASV 4种蛋白偏向使用A/U结尾的密码,目前自然选择是其偏性的主要影响因素,与常用表达系统密码偏性比较分析提示人和酵母菌是LASV疫苗制备的最优外源表达。

  • 标签: 拉沙病毒 密码子偏性 高频密码子 外源表达
  • 作者: 赵倩 宋忠亚 杨勇
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-12-13
  • 出处:《中华皮肤科杂志》 2020年第12期
  • 机构:北京大学第一医院皮肤科 北京市皮肤病分子诊断重点实验室 国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心 100034,北京大学第一医院皮肤科 北京市皮肤病分子诊断重点实验室 国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心 100034;中国医学科学院 北京协和医学院 皮肤病医院遗传中心,南京 210042
  • 简介:摘要目的探究Klhl24基因起始密码突变小鼠毛囊异常的生理表型,为阐明Klhl24调控毛囊发育的机制提供基础。方法将通过CRISPER/Cas9技术构建的Klhl24基因起始密码突变Klhl24c.3G>T杂合(Klhl24c.3G/T)雄性小鼠与野生型雌性小鼠杂交,对同窝小鼠进行基因型鉴定,Klhl24c.3G/T雄性小鼠和野生型(WT)雄性小鼠分别作为实验组与对照组,每组小鼠≥ 3只。在小鼠出生后第21天(第1个毛发静止期)及45天(第2个毛发静止期)进行胶带贴毛实验,对小鼠背部皮肤组织进行Ki67免疫组化检测,并用扫描电镜、透射电镜观察,用脱氧核糖核苷酸介导的dUTP末端标记(TUNEL)试剂盒检测毛囊内凋亡细胞。实验组与对照组检测结果比较采用Dunnett-t检验。结果第1个静止期与第2个静止期Klhl24c.3G/T小鼠每0.25 cm2胶带脱落毛干数量分别为1 224 ± 51.08与1 514 ± 72.15,WT小鼠分别为320 ± 55.68和125 ± 2.86,第1、2个静止期Klhl24c.3G/T小鼠脱落毛干数量均明显多于WT小鼠(t = 11.96、19.24,均P < 0.001)。对第1个静止期脱落毛干进行扫描电镜观测,显示脱落毛干底部呈杵状。出生后第59天时,WT小鼠背部无新毛干长出,毛囊处于静止期,而Klhl24c.3G/T小鼠背部已有新毛干长出,毛囊进入下一个生长期。透射电镜观察显示,在第1个毛囊静止期(P21)Klhl24c.3G/T小鼠背部皮肤毛囊细胞中线粒体内嵴结构混乱,单个毛囊结构中凋亡细胞数量为12 ± 1.15,高于WT小鼠(3 ± 0.63,n = 8,t = 6.874,P < 0.001)。结论Klhl24c.3G/T小鼠毛发异常表型主要为毛囊静止期锚定毛干能力降低,毛囊生长期提前,毛囊细胞中线粒体结构异常,并且凋亡细胞数量增加。

  • 标签: 毛囊 小鼠,突变型 秃发 线粒体 细胞凋亡 Klhl24基因
  • 简介:目的检测胰腺癌及相应癌旁组织K—ras基因第12密码的突变量,分析其与胰腺癌临床病理参数的关系。方法应用肽核酸(peptidenucleicacid,PNA)钳制双荧光标记探针的实时定量PCR法检测93例胰腺癌组织及其癌旁组织中K—ras基因第12密码的突变拷贝数,以突变百分率表示突变量。K-ras基因突变百分率=K—ras突变型拷贝数/(K—ras野生型拷贝数+K-ras突变型拷贝数)×100%。结果胰腺癌及其癌旁组织的K-ras基因第12密码突变率分别为83.9%和65.6%,相差显著(P〈0.05);它们的突变量分别为(13.385±1.745)%和(2.246±0.728)%,相差亦显著(P〈0.05)。K—ras基因第12密码突变量与临床病理参数无关。结论胰腺癌及相应癌旁组织不仅存在K-ras基因突变率的差异,亦存在K—ras基因突变量的差异。

  • 标签: 胰腺肿瘤 K—ras基因 实时定量PCR 突变
  • 简介:摘要目的分析2013—2020年人感染H7N9禽流感密码使用偏好及其影响因素。方法通过NCBI数据库获得病毒全基因组序列,使用CodonW、EMBOSS、R、Origin 9.0、SPSS 20.0等软件分析病毒的碱基构成、密码偏好性参数等。结果H7N9病毒全基因组AU含量高于GC,且AU多出现在密码末位。2013—2020年AU含量逐渐升高,而GC含量逐渐降低。病毒有效密码数在48.71~56.17之间,提示病毒密码使用偏性总体较弱。有效密码数绘图和密码适应指数分析显示病毒密码使用偏好受自然选择和突变压力双重影响,自然选择因素更为明显。结论人感染H7N9禽流感病毒密码使用偏好仍处在不断适应人类宿主的演化过程中,第五波疫情及后续毒株与既往毒株相比存在更加适应宿主的变化。

  • 标签: 禽流感 流感病毒 密码子偏爱性 聚类分析
  • 简介:摘要目的分析具有高广谱中和活性的HIV-1感染者包膜蛋白(Env)基因的氨基酸及密码使用特点。方法根据中和宽度是否高于90%将样本分为高广谱中和活性组(hBCN+组)和非高广谱中和活性组(hBCN-组),采用单拷贝基因组扩增法(SGA)分离全长Env基因,通过两组样本Env基因的相对氨基酸使用度(RAAU)的对应性分析(COA),并基于相似性指数D(A,B)计算及与宿主相对密码使用度(RSCU)的比对探讨两组毒株的氨基酸及密码使用特点。结果对应性分析结果显示hBCN+组和hBCN-组毒株RAAU数据沿两个主轴分布形成两个相对独立的簇,表明两组毒株Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式;相似性指数分析结果显示hBCN+组(0.097)低于hBCN-组(0.102),且两组毒株相比较,hBCN+组Env基因与人具有相似使用模式的密码少于hBCN-组,提示hBCN+组毒株在感染者体内的适应性较hBCN-组毒株低。结论hBCN+和hBCN-两组毒株的Env基因具有相对独特的氨基酸使用模式,hBCN+组毒株对宿主的适应性较hBCN-组毒株低。

  • 标签: HIV-1 膜蛋白 高广谱中和活性 相对氨基酸使用度(RAAU) 相对密码子使用度(RSCU)
  • 简介:摘要目的获取具有生物活性的狂犬病病毒核蛋白在大肠埃希菌表达系统中高效表达。方法实验使用密码优化技术重新编码狂犬病病毒CTN-1株核蛋白基因,人工合成全长基因并克隆至pET-43.1a表达载体,在大肠埃希菌BL21(DE3)株中诱导表达,并使用Western blot检测其反应原性。结果诱导后SDS-PAGE分析显示在相对分子质量50×103处出现明显的表达条带,与预期蛋白质条带大小一致。其中在大肠埃希菌A600为0.5左右,37℃诱导5 h时表达产量最高(约为32.3%)。大量表达时核蛋白的表达形式主要为包涵体,后经Ni2+螯合层析纯化,获得纯度为95%以上的目的蛋白。纯化产物经Western blot鉴定,与疫苗免疫小鼠血清呈阳性反应,表明大肠埃希菌表达CTN-1株核蛋白具有生物活性。结论本实验成功建立了CTN-1株核蛋白在大肠埃希菌表达系统的高效表达方法,并获得了高纯度目的蛋白,为进一步的临床诊断和新型疫苗制备提供基础资料。

  • 标签: 狂犬病病毒 CTN-1株 核蛋白 原核表达 密码子优化
  • 简介:摘要目的对1例临床诊断为小细胞低色素性贫血、排除缺铁性贫血的先证者及其家系成员进行致病基因分析,了解基因型-表型关系。方法应用跨越断点PCR (Gap-PCR)和二代测序(next generation sequencing, NGS)技术检测先证者及家系成员在地中海贫血(简称地贫)缺失和变异型的情况,Sanger测序法对所检测的基因变异进行验证。结果Gap-PCR和NGS测序技术分别检测出α地贫αα/-α3.7缺失型和HBA2基因起始密码HBA2 c.2T>A(p.Met1Lys)杂合变异,在先证者及父亲中均检出αHBA2:c.2T>A(p.Met1Lys)α/-α3.7,母亲及其他家系成员检出结果分别为-α3.7/-α3.7和αα/-α3.7。结论相较于只携带αα/-α3.7的α地贫静止型无症状家系成员,α HBA2 c.2T>A(p.Met1Lys)α/-α3.7表现出更典型的地贫体貌特征及异常血液学指标。HBA2 c.2T>A(p.Met1Lys)变异为致病性变异,新变异的检出丰富了α-地贫致病基因变异谱,为家系的遗传咨询和产前诊断提供了依据。

  • 标签: α-珠蛋白 起始密码子变异 HBA2基因 右侧缺失型
  • 简介:目的通过研究广西地区肝癌患者中黄曲霉毒素B1(AflatoxinB1,AFB1)-DNA加合物的表达和p53第249密码突变情况及其关系,探讨AFB1长期暴露与人群原发性肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)发生的关系。方法实验组为广西医科大学第一附属医院肝胆外科收治的63例HCC患者行根治性手术切除的肝肿瘤组织。按肿瘤大小分为小肝癌组(≤5cm)和大肝癌组(〉5cm),同时小肝癌组包括两个亚组Ⅰ组(≤3cm)和Ⅱ组(〉3cm)。另取10例来自肝移植供肝及肝外伤切除的正常肝组织作为正常对照组。通过免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)法检测各组样本AFB1-DNA加合物的表达,并以PCR结合直接测序的方法检测其p53第249密码的突变情况。结果小肝癌组的AFB1-DNA加合物阳性率最高(73.8%),显著高于大肝癌组(P=0.016)。而小肝癌组p53第249密码的突变率(35.7%)却显著低于大肝癌组(P=0.007)。正常对照组AFB1-DNA加合物阳性率为50.0%,但未发现p53第249密码存在突变。Ⅰ组与Ⅱ组之间无论是AFB1-DNA加合物阳性率还是p53第249密码的突变率差异均无统计学意义(P1=0.676,P2=1.000)。实验组中,33.3%的样本为AFB1-DNA加合物和p53第249密码突变双阳性,22.2%的样本为AFB1-DNA加合物和第249密码突变双阴性。结论广西为AFB1高污染地区,正常人群普遍存在AFB1的暴露。AFB1的暴露可增加HCC的发病概率。p53第249密码突变可能是影响AFB1相关HCC发生、发展的因素。结合AFB1-DNA加合物表达和第249密码突变的情况,可有效地了解肝癌患者长期持续性或非持续性的AFB1暴露下DNA的累积损伤情况。

  • 标签: HCC AFB1 DNA加合物 p53第249密码子 突变
  • 简介:摘要目的探讨鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1密码600的突变(BRAFV600E)在甲状腺乳头状癌中的突变及临床意义。方法分析郑州大学第一附属医院2017年1月1日至2017年12月31日200例甲状腺乳头状癌组织中BRAFV600E突变,探讨BRAFV600E突变与患者临床病理特征的关系。计数资料采用χ2检验。结果BRAFV600E在甲状腺乳头状癌组织中的突变率为91.5%(183/200),与病理诊断率相近,与患者的性别(χ2=0.799,P>0.05)、年龄(χ2=1.110,P>0.05)、肿瘤大小(χ2=0.999,P>0.05)、淋巴结转移(χ2=0.948,P>0.05)以及病灶数量(χ2=0.783,P>0.05)无明显相关。结论BRAFV600E突变与甲状腺乳头状癌的发生发展密切相关,有助于甲状腺乳头状癌患者的诊断及治疗。

  • 标签: 甲状腺癌 鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1密码子600的突变基因 基因突变 病理特征
  • 简介:除了钱,忙碌的现代人最需要的是什么?相信许多人会毫不犹豫的回答“睡觉”。睡眠是人生的1/3,从呱呱坠地的婴儿到耄耋之年的老人,睡眠是生活中至关重要的活动,

  • 标签: 密码 失眠 现代人 睡眠
  • 简介:早就知道广西巴马是长寿之乡,今年6月,我有幸前往巴马实地考察,观察思考巴马的长寿之秘,对长寿之乡的长寿经有了初步的理解。我毕业于中医药大学,又从事过多年中医临床,在此结合中医药和现代医学,对巴马的长寿现象谈谈我的理解。

  • 标签: 巴马 百岁老人 人体营养 味甘性平 现代医学 分子团
  • 简介:医学统计表明,疾病的产生与复发不仅与年龄、性别、饮食习惯、生活条件及所处的环境等诸多因素有关,同时也与一定的时间相联系。因而,有必要搞清什么时候最容易发生何种疾病,什么时候对某种疾病作诊断性检查最合时宜,什么时间用药比较合理等。掌握了相关的"密码",将有利于疾病的预防和治疗,取得事半功倍的效果。

  • 标签: 疾病 密码 破译 医学统计表 诊断性检查 饮食习惯
  • 简介:也许你从来没想到,自己经常随口说的一句话,对宝宝来说,有时竟然是一瓢冷水,让他顿感挫败。赶快来排查一下生活中好妈妈的忌语,别让语言暴力无意中就伤了宝宝稚嫩的心。

  • 标签: 宝贝气质 摸清宝贝 气质密码
  • 简介:摘要:中医人体的“生命密码”,是人体生命内气结构规律的科学体现。是中医“阴阳五行”生理与病理的理性升华;是破解人体从健康到病变直至生命结束的理性公式。生命密码的发现,彻底地展现了贯穿在人体肉体生命中内气结构的本质,使人体为什么会有病、人体的病有那些规律、人体从病变到生命结束,是怎样地演化过程,有了基本的解释。

  • 标签: 人体形成,人体特性,人体设定
  • 简介:如果孩子说谁交了异性朋友;或者父母已知孩子有了知心的异性同学,可以这样告诉孩子:“你见过蓝天上的白云吗?清晨起来,看见蓝天上飘着白云,多么纯洁、美丽,令人喜爱;但是等到中午放学时再抬头看,清晨那朵白云不见了。青春期少男少女的友情,就像蓝天上的白云,美丽而脆弱,诱人而易变。”对经

  • 标签: 孩子青春 解读孩子 青春密码
  • 简介:

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  • 简介:高频心电图(HihgFrequencyElectro-cardiogram)是在常规心电图基础上发展起来的一项新的心脏无创伤性检查技术。是用高频心电图机描记的含有高频成分的心电图。高频心电图有三个特点:1.频响宽,其频响在80Hz以上,可达2k、3kHz,故又称宽频心电图。2.扫描速度快,为100~700mm/

  • 标签: 高频心电图 常规心电图 扫描速度 检查技术 无创伤性 高频成分
  • 简介:摘要目的研究潜意识思维及与心理密码的关系。方法对知觉的分析、心理密码应用的探讨。结果潜意识存在广泛思维活动,心理密码是思维结果的一部分。

  • 标签: 知觉 潜意识思维 心理密码
  • 简介:医学上早已认定体型与健康关系密切。国内相关专家为你一解读身体尺寸里的健康密码

  • 标签: 身体尺寸 健康 密码