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  • 简介:塔兰图拉毒蛛毒液为学习毒素选择,结构活动关系和肽毒素的分子的进化提供一个模型系统。以前的研究鉴别了中国鸟的毒液地的很多肽毒素搜寻Haplopelmahainanum,通常认为是一只高度有毒的蜘蛛。然而,可得到的RNA-seqtranscriptomic的缺乏和genomic数据是到在分子的水平理解它的毒液的一个障碍。在这研究,我们调查了H的毒液腺transcriptome。由RNA-seq的hainanum,当一个可得到的genomic序列不在时。我们鉴别在57181denovo之中的201潜在的毒素装配了抄本,包括knottins,Kunitz类型毒素,酶和另外的蛋白质。我们系统地识别了大多数knottins和Kunitz类型毒素,其中一些强烈出现了,在毒液腺偏导表示包括huwentoxin-1的成员,huwentoxin-2和magi-1家庭。我们也发现了几新奇潜在的毒素。这些数据在H的毒液毒素表明高分子、结构的差异。hainanum。这研究为探索蜘蛛毒液的复杂部件提供有用策略。

  • 标签: 多肽毒素 海南捕鸟蛛 毒蜘蛛 转录组 毒腺 鉴定
  • 简介:InFebruary2006,twooutbreaksofhighlypathogenicavianinfluenzaAvirussubtypeH5N1occurredinchickensintwoneighboringdistricts(firstinNandurbarandsecondinJalgaon)ofMaharashtra,India,inaspanof12days.Inthepresentstudy,theneuraminidase(NA)geneofthetwoIndianH5N1isolateswastakenintoconsiderationtofindifthetwostrainsaregeneticallysimilar.PhylogeneticanalysisoftheNAgeneshowedthattheH5N1strainsisolatedfromthetwooutbreakswerenotoriginatedfromthesamesource.ThefirstIndianisolate(Nandubar/7972/06)wasclusteredclosesttoanisolatefromchickeninVietnamin2004,whereasthesecondIndianisolate(Jalgaon/8824/06)showedresemblancetostrainsisolatedfromswaninItalyandIranin2006.Moreover,aminoacidsequenceanalysisshowedvaryinghotspotsforsubstitutionsbetweenthesetwoIndianisolates,andthreesubstitutionswerefoundatfunctionaldomainsites.Secondarystructurechangesduetothesesubstitutionswerealsoreported.ThisstudyrevealsthattheH5N1strainsisolatedfromchickensduring2006birdfluoutbreaksintwoneighboringdistrictsofMaharashtra,Indiaaregeneticallydifferent.

  • 标签: 神经氨酸酶基因 H5N1亚型 系统发育分析 禽流感疫情 印度 菌株