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8 个结果
  • 简介:技术显著地改进了定序产量并且减少的下一代的定序的出现(NGS)花费。然而,短读的长度,副本读并且数据的巨大的体积使处理的数据比归化为美国人的定序技术更困难、复杂。尽管有包裹开发了估计数据质量的某软件,那些包裹任何一个不对用户容易可得到或要求生物信息学技巧和计算机资源。而且,当前可得到的几乎所有优秀评价软件当在NGS数据处理副本评价时,考虑定序的错误。这里,我们在场一个新用户友好的优秀评价软件包裹叫了BIGpre,它为Illumina和454个平台工作。BIGpre包含另外的优秀评价软件的所有函数,例如关联在之间前面、反向读,读GC内容分发,和基础N质量。更重要地,BIGpre合并联系程序检测并且搬迁副本在订定序错误进报道并且整修低质量以后读也从未加工的数据读。BIGpre首先在Perl被写并且从统计包裹R集成图形的能力。这个包裹为从Illumina和454个平台定序数据集生产数据质量的平坦、图形的摘要。处理几百百万在分钟以内读,这个包裹提供立即的诊断信息让用户操作为下游的分析定序数据。BIGpre在http://bigpre.sourceforge.net是自由地可得到的。

  • 标签: 质量评估 序数 测序技术 数据读取 用户操作 数据处理
  • 简介:Weconductedacomprehensivestudytoinvestigatetheaerodynamiccharacteristicsandforcegenerationoftheelytraofabeetle,Allomyrinadichotoma.Ouranalysisincludedwindtunnelexperimentsandthree-dimensionalcomputationalfluiddynamicssimulationsusingANSYS-CFXsoftware.Ourfirstapproachwasaquasi-staticstudythatconsideredtheeffectofinducedflappingflowduetotheflappingmotionofthefore-wings(elytra)atafrequencyofaround30Hzto40Hz.Thedihedralanglewasvariedtorepresentflappingmotionduringtheupstrokeanddownstroke.Wefoundthatanelytronproducespositiveliftat0°geometricangleofattack,negativeliftduringtheupstroke,andalwaysproducesdragduringboththeupstrokeanddownstroke.Wealsofoundthattheliftcoefficientofanelytrondoesnotdropevenataveryhighgeometricangleofattack.Forabeetlewithabodyweightof5g,basedonthequasi-staticmethod,thefore-wings(elytra)canproduceliftoflessthan1%ofitsbodyweight.

  • 标签: ELYTRA ANGLE of ATTACK dihedral ANGLE
  • 简介:Wehavepreviouslydevelopedacombinedsignal/variancedistributionmodelthataccountsfortheparticularstatisticalpropertiesofdatasetsgeneratedontheAp-pliedBiosystemsAB1700transcriptomesystem.Hereweshowthatthismodelcanbeefficientlyusedtogeneratesyntheticdatasetswithstatisticalpropertiesvirtu-allyidenticaltothoseoftheactualdatabyaidoftheJAVAapplicationace.mapcreator1.0thatwehavedeveloped.ThefundamentallydifferentstructureofAB1700transcriptomeprofilesrequiresre-evaluation,adaptation,orevenrede-velopmentofmanyofthestandardmicroarrayanalysismethodsinordertoavoidmisinterpretationofthedataontheonehand,andtodrawfullbenefitfromtheirincreasedspecificityandsensitivityontheotherhand.Ourcompositedatamodelandtheace.mapcreator1.0applicationtherebynotonlypresentproofofthecor-rectnessofourparameterestimation,butalsoprovideatoolforthegenerationofsynthetictestdatathatwillbeusefulforfurtherdevelopmentandtestingofanalysismethods.

  • 标签: 生物系统 微阵列分析 信号传递 综合数据生成
  • 简介:人的导致的pluripotent茎(iPS)房间类似于胚胎的茎(ES)房间,和罐头强烈地增殖并且区分进许多房间类型。然而,人的iPS房间的肝的区别还没被报导了。在这份报告,人的iPS房间被导致由一个逐步的协议区分进肝的房间。肝房间标记的表达式和人的iPS的肝相关的函数导出房间的房间被监视并且与区分的人的ES房间和主要人的hepatocytes的相比。在白天7点的约60%区分的人的iPS房间表示了肝的标记alphafetoprotein和白长袍的。在白天21点的区分的房间包括白朊Asecretion,肝糖合成,脲生产和可诱导的细胞色素P450活动展出了肝房间功能。肝的标记的表示和iPS的肝相关的功能导出房间的肝的房间比得上人的ES导出房间的肝的房间的。这些结果证明人的iPS房间,类似于人的ES房间,能高效地被导致区分房间进象hepatocyte一样。

  • 标签: 人类胚胎干细胞 人肝细胞 诱导分化 多能性 细胞色素P450 细胞分化