简介：摘要目的研究深圳市啮齿动物所携带的汉坦病毒分子流行病学特征，分析汉坦病毒基因型别。方法采用笼日法布点捕鼠，收集鼠肺标本后研磨提取RNA。运用实时荧光PCR方法进行分型检测，进一步采用反转录-巢式PCR扩增部分M片段G2区和S片段核苷酸序列，并进行同源性和系统进化树分析。结果共捕获200只鼠类动物，包含褐家鼠189只、黄胸鼠9只和小家鼠2只。汉坦病毒检出率为21.0%（42/200），均为汉城病毒，其中宝安区鼠肺检出率最高，达45.7%（χ2=25.60，P<0.05）。从阳性鼠肺标本中分别扩增出25条汉坦病毒M片段G2区和S片段序列，核苷酸同源性分别为95.3%~100.0%和97.6%~100.0%，与来自广州市的参考序列核苷酸相似性较高。系统进化树显示此次研究深圳市鼠类动物所携带的汉坦病毒均为汉城病毒的S2亚型。氨基酸突变位点分析发现，在S基因编码的核衣壳蛋白中存在1个位点突变，为BA-111第973位由丙氨酸（Ala）变为苏氨酸（Thr）。结论深圳市鼠类动物所携带的汉坦病毒为汉城病毒的S2亚型，与深圳市历年以及周边省市汉坦病毒代表病毒毒株相比变异不大。

简介：摘要目的了解深圳市2018年登革热疫情的流行病学特征和流行毒株的基因分型。方法采用描述性流行病学方法分析2018年深圳市登革热疫情，采集患者血液标本，采用胶体金免疫层析法检测血清特异性IgM、IgG抗体，采用实时荧光定量聚合酶链反应进行病原学检测和基因型别鉴定。采用反转录聚合酶链反应扩增登革病毒E基因序列，与不同国家和地区的登革热流行毒株进行同源性比较和进化树分析。结果2018年1月1日至12月31日，深圳市累计报告登革热234例，发病率为1.87/10万，本地病例144例(61.54%)，输入病例90例(38.46%)，以东南亚国家及深圳市周边城市输入为主。发病时间集中在8月至11月，共202例(86.32%)。以20～50岁中青年患者为主(195例，83.33%)。登革病毒1型(dengue virus type 1，DENV-1)占86.01%(166/193)，登革病毒2型(dengue virus type 2，DENV-2)占10.36%(20/193)，登革病毒3型占2.59%(5/193)，登革病毒4型占1.04%(2/193)，且本地病例均为DENV-1感染。24株DENV-1毒株与HAWAII45毒株E基因核苷酸同源性为93.0%～94.6%，氨基酸同源性为96.6%～97.2%。其中23株为基因Ⅰ亚型；1株为基因Ⅳ亚型，为深圳市首次报道的输入性病例。6株DENV-2毒株与国际标准株NGC株E基因核苷酸同源性为93.1%～93.9%，氨基酸同源性为97.0%～97.8%。其中2株为Cosmopolitan亚型；4株为Asian Ⅰ亚型，为深圳市首次报道。结论2018年深圳市登革热流行具有本地传播与输入传播并存的特点，主要流行为DENV-1，推测主要流行株由东南亚国家及深圳市周边城市输入，应加强关注出现地方性登革热流行的趋势。