简介:为了解香蕉NBS抗病基因的密码子使用特点,掌握其基因编码规律,以香蕉全基因组NBS基因的74条高置信蛋白编码信息为数据来源,借助CodonW等软件对蛋白质的每个氨基酸编码数据进行了统计分析。结果表明,G+C含量范围为32.8%~45.4%,共鉴定获得了GUC和UAC等8个最优密码子且全部以G或C结尾。中性绘图分析发现,大部分基因分布在对角线及其附近区域,ENC与GC3的关联分析显示大部分基因落在标准曲线附近,这些都表明密码子偏好性受到碱基突变影响较大。密码子各参数相关性分析表明,ENC和G3s、C3s的大小都呈显著负相关,在基因表达密码子使用时,更倾向于选择第三位碱基是G/C的同义密码子。本研究分析了香蕉全基因组NBS基因的密码子偏好性,为通过密码子优化来提高NBS基因在香蕉中的表达,对香蕉进行抗性改良具有十分重要的指导作用。
简介:比较分析了甲烷八叠球古菌(Methanosarcinamazeistr.Goel)和其他2种系统发育相关的广古细菌(嗜苦古菌(Picrophilustorridusstr.DSM9790)和盐碱古菌(Natronomonaspharaonisstr.DSM2160))的同义密码子使用偏好性.结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小,并且与GC3S值有很高的相关性.这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守.通过分层聚类分析,得出较之基因功能对密码子使用的影响,这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的.考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中,推测其生活环境在很大程度上决定了这些微生物密码子的使用方式.
简介:【摘要】目的:依从性差常导致痤疮治疗失败,而患者先入为主的偏好会影响其对治疗方法的选择及依从性。本研究拟探讨痤疮患者对现有疗法的选择偏好,并理解其原因,为制定更好的医疗决策提供参考。方法:通过问卷星对皮肤科门诊的痤疮患者发放调查问卷,内容包括一般情况、病程、严重程度的自我评估、患者对痤疮的认知及其对疗法的选择偏好及其原因。结果:共有202名痤疮患者完成调查,病程超过12个月的患者占58.42%,自我评估为轻度占51.49%。认为痤疮是长期慢性疾病占68.81%。在治疗偏好上,49.01%的患者最喜欢外用药物,使用方便和安全、无副作用是主要原因。果酸换肤等其他疗法(37.62%)和口服药物(33.66%)是患者最不喜欢的方法,主要原因是“担心会有疼痛感”和“担心使用后会出现药物的副作用”。结论:患者对痤疮疾病的认知和治疗偏好存在先入为主的观点。医生在制定治疗策略时,除向患者提供最佳的循证医学证据以外,还需充分考虑其偏好,以提高治疗依从性。