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  • 简介:摘要药物基因是一门研究遗传变异对药物效能和毒性的影响的科学,基因多态性是其基础和重要的研究内容。药学基因的应用范围包括开辟药物研究的领域,促进合理用药的发展,加快临床前及临床药理的研究,以及对药物经济的影响。

  • 标签: 药物基因组学 应用 研究
  • 简介:摘要阐明病原微生物致病基因及其产物对于了解其致病性至关重要。由于致病机制复杂,因此有必要了解微生物细胞内哪些基因与体内定居有关、哪些与体内持续感染有关、哪些与毒力有关。如果能对病原微生物进行全基因测序,配合现代生物信息软件对基因顺序加以分析,就能对致病基因及产物、病原菌与宿主的关系以及病原菌引起的临床后果作出准确快速的判断。

  • 标签: 病原微生物 基因组 研究
  • 简介:概述了竹类植物基因研究进展,包括对核酸信息的认知以及通过反向遗传对重要性状相关基因功能的认知;分析了目前包括现代生物技术、可再生生物资源、生态文明所带来的良好发展机遇;提出了竹类植物基因复杂、开花特殊、遗传转化体系不完善等基因研究所面临的瓶颈问题及其对策。

  • 标签: 竹类植物 基因组学 进展 机遇 挑战
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  • 简介:毒理基因是利用DNA微阵列技术,研究化合物作用于机体后的基因变化,将技术与传统毒理学及组织病理学相结合,评价和预测化合物的毒性的一门学科。随着毒理基因的广泛应用,免疫毒理学领域也开始利用基因表达谱来分析化合物的免疫毒性。目前认为免疫毒理基因可能在下述3个方面具有较高的应用价值,即免疫毒性物质的筛选、免疫毒性作用机制的研究以及免疫毒性风险评估。现围绕这3个方面,对毒理基因在免疫毒理学领域中的应用进行阐述。

  • 标签: 毒理基因组 免疫毒理学 药物安全 风险评估
  • 简介:文叙述了加拿大一次结核爆发事件的流行病研究成果。除了传统的流行病研究方法——社会网络调查之外,研究者还利用了分子流行病的技术——基因测序方法,找出此次爆发结核杆菌的流行病特点:很可能是精制可卡因的使用增多触发了两个现存的结核分枝杆菌谱系的同时扩展,而高危社交网络的关键成员则起了维持作用。流行病基因的结合也预示着未来“分子流行病”的发展趋势。

  • 标签: 分子流行病学 结核分枝杆菌 基因组学 战役 流行病学特点 爆发事件
  • 简介:生物修复在海洋石油污染治理中具有重要地位,虽然目前环境中可以培养的微生物比例很低,但微生物的基因资源十分丰富,因此借助宏基技术可以克服传统生物修复技术中微生物资源利用不充分的问题,为利用未培养微生物开展环境修复提供了有效途径。本文简要介绍了宏基技术实施的方式,并结合海洋石油污染的特点,对该技术的应用现状作了阐述。

  • 标签: 宏基因组 石油污染 生物修复
  • 简介:近年来,一系列重要医学致病真菌全基因数据陆续被公布,使人类对这些致病菌的认识提高到全新水平。本文在回溯医学真菌基因基因测序技术发展历程、综述其发展现状及应用的基础上,再分别介绍重要医学真菌全基因测序的进展。

  • 标签: 真菌 全基因组测序 念珠菌 隐球菌 曲霉 青霉
  • 简介:利用生物信息手段,结合公共大豆基因数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆的16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达的基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基础。

  • 标签: GST家族 全基因组筛选 分类分析 差异表达基因
  • 简介:人工核酸酶介导的基因编辑(genomeeditingwithengineerednucleases)技术是近几年发展起来的一种技术手段,被《NatureMethods》杂志评为2011年的年度技术。家蚕的基因编辑在研究家蚕功能基因、培育家蚕新型素材、家蚕生物反应器开发领域有着巨大的应用潜力。西南大学家蚕功能基因研究团队紧跟国际上基因编辑技术的最新发展趋势,迅速在家蚕基因编辑研究领域开展相关研究工作。2012年9月,该团队在《PLoSONE》杂志上公布了其利用近期发展起来的基因编辑工具-TALE核酸酶技术(TALEN)实现对家蚕内源靶基因的可遗传敲除的研究成果,该论文发表以后受到国内外众多媒体的转载与评论,发表之后的短短一年时间内即被包括《NatRevMolCellBiol》、《GenomeRes》等高水平杂志在内的论文引用28次。随后,研究团队又围绕着建立高效的家蚕基因编辑技术平台开展研究工作,建立了适用于家蚕基因编辑的TALEN高效组装技术体系和活性检测平台。通过组装平台,研究人员可以高效的对人工设计的TALEN打靶载体进行组装。通过活性检测平台,研究人员可以便利地对组装的TALEN打靶载体的打靶效率进行评估,筛选高活性的TALEN打靶载体,这对提高对家蚕功能基因敲除,尤其是可遗传敲除的成功率有着重大意义。该体系的建立标志着家蚕基因编辑技术平台的完善和成熟,为实现家蚕功能基因的大规模敲除打下了坚实基础。相关研究论文“High-efficiencysystemforconstructionandevaluationofcustomizedTALENsforsilkwormgenomeediting”于2013年9月28号在国家权威杂志《MolecularGeneticsandGenomics》上在线发表(http://link.springer.com/article/10.1007/s00438-013-0782-4)。西南大学家蚕基因生物国家重点实验室博士研究生王峰、马三垣为论文�

  • 标签: 家蚕生物反应器 功能基因组 编辑技术 大学 西南 SILKWORM
  • 简介:该实验通过SDS高盐法(常规法)、SDS高盐法(改良法)和SoilgDNAKit法提取土壤微生物基因DNA,用DNANanophotometer仪测定样本DNA的纯度和浓度,以确定最佳提取方法.结果表明,用SDS高盐法(常规法)、SDS高盐法(改良法)和SoilgDNAKit法和土壤微生物基因DNA的浓度分别为41.45ng/μl、96.48ng/μl和58.40ng/μl,纯度(OD260/OD280)分别1.45、1.57和1.82.由结果可知,改良法提取DNA的浓度最高,而SoilgDNAKit法的纯度最高,但其成本较高,因此,SDS高盐法(改良法)是节省成本且适合提取大批量土壤微生物基因DNA的方法,今后在提取DNA过程中进一步优化,以提高其纯度.

  • 标签: 土壤微生物 DNA提取 PCR
  • 简介:毛竹基因测序研究项目在国际竹藤中心举行了成果新闻发布会。据介绍,毛竹是禾本科竹亚科中最具生态和经济价值的物种,具有非常独特的生物特性和科学价值。我国现有毛竹林面积386万hm2,占全国森林面积的2%。

  • 标签: 基因组测序 毛竹 新闻发布会 生物学特性 经济价值 科学价值
  • 简介:在此,我们报道一个黄龙病菌亚洲种(‘CandidatusLiberibacterasiaticus’)(广西-1菌株)的全基因序列。该菌株基因由1个环状染色体构成,大小为1,268,237bp,G+C含量为36.5%,包含1,141个开放阅读框,44个tRNA,3个完整的rRNA。

  • 标签: 全基因组序列 中国菌株 亚洲 病菌 黄龙 开放阅读框
  • 简介:DNA条形码技术(DNABarcoding)是一种用短的标准DNA片段快速、准确地识别与鉴定物种的技术。近年来,物种分类和生物多样一直是研究的热点,目前DNA条形码开始广泛应用于生物的遗传多样性研究。本文主要概述了DNA条形码技术的原理、标准基因片段,着重阐述了其在生物分类和遗传多样性等研究中的应用及其局限性,展望了其发展状况、应用前景和意义。

  • 标签: DNA条形码 物种分类 标准基因片段 遗传多样性
  • 简介:目的研究乙肝病毒/黄曲霉毒素B1双暴露相关性肝细胞性肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)染色体遗传畸变的特点。方法将32例手术切除经病理证实为HCC的癌组织,按照乙肝病毒与黄曲霉毒素的暴露情况分为4个亚:A为HBV(+)/AFB,(+)10例;B为HBV(+)/AFB1(-)10例;C为HBV(-)/AFB1(+)6例;D为HBV(-)/AFB1(-)6例。应用微阵列比较基因杂交技术(ArrayCGH)检测分析其22对染色体DNA拷贝数的变化。结果32例HCC样本中,共发现573个染色体畸变区段(chromosomalaberrations,CNAs)。其中1q、4p、5p、6p、7p、8q、10p、17q、20p、20q和X主要表现为扩增区段;1p、2q、4q、8p、9p、10q、11q、13q、14q、16p、16q、17p、19p、19q、21q、22q和Y主要表现为缺失区段。同时,共检测出25个染色体发生高频畸变的区段(recurrentlyalteredregions,RARs),其中lq21.1-q44、5p13.2-p15.3、6p12.1-p25.2、7q11.2-q35、8q11.2-q24.3、17q12-q25.2、18q12.3-q22.3和x为高频率扩增区段,而lp31.1-p36.2、2q23.2-q37.2、4q12-q35.2、6q14.1-q26、8p12-p23.2、9p21.1-p24.2、10q21.3-q26.2、13q12.1-q21.1、14q21.3-q32.2、16p12.1-p13.2、16q12.1-q24.1、17p12-p1313、19p13.1-p13.3、19q13.2-q13.4、21q21.3-q22.2、22q11.2-q13.2和Y染色体为高频缺失区段。8p12-p23.2缺失的发生率在进展期HCC(TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期)中明显高于早期HCC(TNM分期为I~Ⅱ期)(仁0.038)。4q12-q35.2、13q12.1-q21.1的缺失及7q21.1-q35的扩增发生率在A中最高。Cox模型分析结果示:在单因素分析中AFP水平、肿瘤大小、TNM分期、BCLC分期、侵袭与转移的发生、8p12-p23.2的缺失以及19p13.1-p13.3的缺失等为影响患者无瘤生存时间的危险因素(P〈0.05).而在多因素分析中AFP水平、TNM分期以及8p12-p23.2的缺失等为影响患者无瘤生�

  • 标签: 肝肿瘤 乙肝病毒 黄曲霉毒素B1 染色体 Array CGH
  • 简介:目的:以转坛£抗虫基因白桦的不同月份叶片为实验材料,揭示基因DNA甲基化水平与植物叶片发育及外源基因表达水平之间的相关性。方法:应用DNA-MSAP方法检测叶片基因DNACCGG位点甲基化状态,利用Northern杂交技术分析其外源基因表达水平。结果:转基因白桦叶片基因DNA同年5~9月总甲基化水平分别为21.95%、29.62%、25.41%、41.39%和47.24%,除7月份稍有波动外,整体呈现随着叶片的成熟和衰老渐升高趋势;全部扩增位点中,半、全甲基化位点比例分别为17.99%和15.19%,在各月份叶片中变化较大,其中半甲基化位点比例分别为10.37%、19.14%、14.92%、17.2%和28.83%,全甲基化位点比例依次为11.58%、10.49%、10.50%、24.11%和18.40%。同一无性系外源基因在当年5~7月表达量最高,8~9月呈下降趋势,与基因甲基化状态呈负相关趋势。结论:转基因白桦叶片的成熟和衰老及外源基因表达量降低均可能与基因DNA甲基化水平的升高相关。

  • 标签: 转基因白桦 基因组 甲基化 甲基化敏感扩增多态性
  • 简介:<正>文章发表于2013年11月的《PrenatalDiagnosis》上。该研究是美国的一项前瞻性研究,旨在通过羊水游离RNA测定全基因表达谱,阐明双胎输血综合征(TTTS)所涉及的生物通路。共有8例TTTS和8例正常单胎妊娠作为匹配对照纳入研究。所有标本从羊水中提取RNA后逆转为cDNA后利用芯片行微阵列杂交。结果提示TTTS病例

  • 标签: 全基因组 双胎输血综合征 羊水 受血 前瞻性研究 生物学指标
  • 简介:为进一步培养本科生对生物科学的兴趣,了解祖国博大精深的蚕丝文化,并为广大优秀大学生提供一个亲身体验实验室浓厚科研氛围和优良人文环境的交流平台,由西南大学研究生院主办、家蚕基因生物国家重点实验室承办的“2013学术夏令营”活动于7月20日正式开营。

  • 标签: 国家重点实验室 夏令营 生物学 基因组 学术 家蚕
  • 简介:2013年9月11日,科技部陈小娅副部长一行来到西南大学家蚕基因生物国家重点实验室检查指导工作,并听取了西南大学基础科技工作情况汇报。出席汇报会的还有向仲怀院士和学校党委书记黄蓉生、校长张卫国、党委副书记张跃光、副校长李明、副校长周常勇等。

  • 标签: 国家重点实验室 生物学 基因组 副部长 科技部 家蚕