简介：Thecommonapproachtofindco-regulatedgenesistoclustergenesbasedongeneexpression.However,duetothelimitedinformationpresentinanydataset,genesinthesameclustermightbeco-expressedbutnotnecessarilyco-regulated.Inthispaper,weproposetointegrateknowntranscriptionfactorbindingsiteinformationandgeneexpressiondataintoasingleclusteringscheme.Thisschemewillfindclustersofco-regulatedgenesthatarenotonlyexpressedsimilarlyunderthemeasuredconditions,butalsosharearegulatorystructurethatmayexplaintheircommonregulation.Wedemonstratetheutilityofthisapproachonamicroarraydatasetofyeastgrownunderdifferentnutrientandoxygenlimitations.Ourintegratedclusteringmethodnotonlyunravelsmanyregulatorymodulesthatareconsistentwithcurrentbiologicalknowledge,butalsoprovidesamoreprofoundunderstandingoftheunderlyingprocess.Theaddedvalueofourapproach,comparedwiththeclusteringsolelybasedongeneexpression,isitsabilitytouncoverclustersofgenesthatareinvolvedinmorespecificbiologicalprocessesandareevidentlyregulatedbyasetoftranscriptionfactors.

简介：本文首先介绍了固定CO2的意义及方法,然后分析了微生物固定CO2技术流程,接下来阐述了微生物种群及生物反应器类型,最后重点讨论了微生物固定CO2的应用(以微型藻类在CO2吸收与资源化中的应用为例),以期为同行提供有益借鉴与参考。

简介：Theadaptivetreatmenttolerance(ATT)ofcancercellsisthemainencumbrancetocancerchemotherapy.Apotentialsolutiontothisproblemistotreatcancercellswithmultipledrugsusingnanoparticles(NPs).Inthisstudy,wetestedtheco-administrationofcurcumin(Cur)anddoxorubicin(Dox)toMCF-7resistantbreastcancercellstoblocktheATTandelicitefficientcellkilling.Drugswereco-administeredtocellsbothsequentiallyandsimultaneously.Sequentialdrugco-administrationwascarriedoutbypre-treatingthecellswithalbuminnanoparticles(ANPs)loadedw让hCur(Cur@ANPs)followedbytreatmentwithDox-loadedANPs(Dox@ANPs).Simultaneousdrugco-administrationwascarriedoutbytreatingthecellswithANPsloadedwithboththedrugs(Cur/Dox@ANPs).Wefoundthatthesimultaneousdrugco-administrationledtoagreaterintra-cellularaccumulationofDoxandcellkillingwithrespecttothesequentialdrugco-administration.However;thesimultaneousdrugco-administrationledtoalowerintracellularaccumulationofCurwithrespecttothesequentialdrugco-administration.WeshowedthatthisresultwasduetotheaggregationandentrapmentofCurinthelysosomesassoonasitwasreleasedfromCur@ANPs,aphenomenoncalledlysosomotropism.Incontrast,thesimultaneousreleaseofDoxandCurfromCur/Dox@ANPsintothelysosomesledtolysosomalpHelevation,which,inturn,avoidedCuraggregation,ledtolysosomeswellinganddrugreleaseinthecytosol,andfinallyprovokedefficientcellkilling.Ourstudyshedthelightonthemolecularprocessesdrivingthetherapeuticeffectsofanti-cancerdrugsco-administeredtocancercellsindifferentmanners.

简介：miRNAsarenon-codingsmallRNAsthatinvolvediversebiologicalprocesses.Untilnow,littleisknownabouttheirrolesinplantdroughtresistance.Physcomitrellapatensishighlytoleranttodrought;however,itisnotclearaboutthebasicbiologyofthetraitsthatcontributeP.patensthisimportantcharacter.Inthiswork,wediscovered16droughtstress-associatedmiRNA(DsAmR)familiesinP.patensthroughcomputationalanalysis.DuetothepossiblediscrepancyofexpressionperiodsandtissuedistributionsbetweenpotentialDsAmRsandtheirtargetinggenes,andtheexistenceoffalsepositiveresultsincomputationalidentification,thepredictionresultsshouldbeexaminedwithfurtherexperimentalvalidation.WealsoconstructedanmiRNAco-regulationnetwork,andidentifiedtwonetworkhubs,miR902a-5pandmiR414,whichmayplayimportantrolesinregulatingdrought-resistancetraits.Wedistributedourresultsthroughanonlinedatabasenamedppt-miRBase,whichcanbeaccessedathttp://bioinfor.cnu.edu.cn/ppt_miRBase/index.php.OurmethodsinfindingDsAmRandmiRNAco-regulationnetworkshowedanewdirectionforidentifyingmiRNAfunctions.

简介：[背景]西花蓟马于2003年入侵中国后,迅速传播扩散并在局部区域造成严重危害,对我国蔬菜、花卉及果树产业的健康发展构成了巨大威胁.[方法]以线粒体DNA标记技术,对采自我国13个省（市）不同地理区域西花蓟马种群的175条COⅠ基因进行序列变异及群体遗传结构分析.[结果]试验共检测到13个单倍型,各地理种群西花蓟马的单倍型多样性Hd较高,为0.691,而核苷酸多样性π较低,为0.00652.总体固定指数Fst为0.24359,基因流Nm为0.78;种群之间固定指数和基因交流分析表明,我国各地理种群间可能出现了一定分化.种群间AMOVA分析显示,我国西花蓟马的遗传变异主要来自种群内部.对国内外不同地理种群COⅠ基因序列的单倍型进行聚类分析表明,我国西花蓟马有2个品系,即温室品系和羽扇豆品系,其中羽扇豆品系来源于新西兰和荷兰,而广泛存在的温室品系存在多个入侵来源.[结论与意义]我国西花蓟马各地理种群的发生,既与国际贸易活动有关,又与国内蔬菜、花卉、水果等的调运以及观光旅游密不可分.研究结果对西花蓟马的有效阻截及其种群扩张趋势监测意义重大.

简介：【背景】番茄潜叶蛾是源自南美洲的一种最具毁灭性的世界性入侵害虫，其适生区范围广，且与其他潜叶类昆虫难以准确、快速识别。【方法】以田间常见的其他6种潜叶类害虫为对照，采用基于mtDNACOl基因的种特异性SS—COI方法，研究番茄潜叶蛾快速分子检测技术。【结果】种特异性检测结果显示，SS-COl引物只对番茄潜叶蛾mtDNA具有扩增能力，对美洲斑潜蝇、南美斑潜蝇、三叶草斑潜蝇、葱斑潜蝇、豌豆潜叶蝇、桃潜叶蛾等其他潜叶类害虫不具有扩增效果。该引物不仅对成虫和单粒卵具有很好的扩增效能，对单根触角、头部、胸部、腹部以及翅和足等成虫残体亦具有同样的扩增能力，其最低检出阈值为312．5Pg·μL^-1。【结论与意义】该方法在有效防范番茄潜叶蛾侵入我国，保障农业生产安全和生态环境安全中意义重大。

简介：【目的】梣粉虱是新近人侵中国大陆的一种危险性果树和园林植物害虫,针对其体型微小,与近缘种粉虱形态相仿,很难快速准确区分的问题,以田间常见的11种/隐种粉虱为参考,采用基于mtDNA细胞色素C氧化酶亚基I（mitochondrialDNAcytochromecoxidasesubunitI,mtDNAC0I）基因的物种特异性（species-specificCOI,SS-COI）PCR法,研究梣粉虱快速分子检测鉴定技术.【方法】利用mtDNACOI基因通用型引物对LC0-1490/HC0-2198获得梣粉虱和其他常见粉虱的C0I基因序列,根据测序结果设计梣粉虱特异性SS-COI引物1对（SPZWCF1/SPZWCR1）,之后确定其对目的片段的扩增长度,并对该引物对的物种特异性和检测灵敏性进行检验.【结果】引物对SPZWCF1/SPZWCR1扩增片段的长度为426bp.物种特异性检验结果显示,该对引物只对梣粉虱的mtDNAC0I基因具有扩增效果,对我国常见的其他种类的粉虱包括5种烟粉虱隐种（AsiaI、AsiaH1、AsiaH3、MED、MEAM1隐种）以及桑粉虱、螺旋粉虱、黑刺粉虱、柑橘粉虱、双钩巢粉虱和温室粉虱等不具有交叉反应和扩增能力.灵敏性检验结果显示,该对引物不仅对不同性别、不同采集地的成虫具有良好的扩增效能,对2～4龄若虫以及单粒卵和初孵若虫亦具有同样的扩增效力,其最低检测阈值为75.1pg·μL^-1（相当于1/10240头雌性成虫）.【结论】该技术体系可用于梣粉虱的快速准确鉴定及其检测和监测,对有效阻截其进一步传播扩散具有重要作用.

简介：【背景】米尔顿姬小蜂是一种入侵我国台湾地区的植食性小蜂,能够严重影响水果的产量和食用价值。目前在我国大陆没有分布,由于其个体微小,与近似种区别较小,通过传统的形态学分类方法难以鉴定,因此有必要研究其基因片段序列,探讨分子鉴定方法。【方法】利用PCR方法扩增并测定了米尔顿姬小蜂线粒体16SrRNA和COⅠ基因的部分序列,并对各序列的碱基组成进行了分析。然后根据COⅠ基因部分序列,利用DNAMAN的MaximumLikelihood方法构建了米尔顿姬小蜂与膜翅目其他科的系统发育树。【结果】16SrRNA基因的PCR扩增产物为426bp,COⅠ基因的PCR扩增产物为488bp。通过测序获得米尔顿姬小蜂16SrRNA和COⅠ基因部分序列,序列分析表明,16SrRNA和COⅠ基因的A+T含量均较高,存在较强的A+T偏向性。系统发育树显示,米尔顿姬小蜂与蚜小蜂科的Encarsiaberlesei亲缘关系最近,与姬小蜂科的Chrysocharisnautius、C.eurynota亲缘关系较远。【结论与意义】本研究为米尔顿姬小蜂的分子鉴定提供了依据。

简介：目的观察超脉冲点阵CO2激光联合1%卢立康唑乳膏外用封包治疗甲真菌病的疗效及安全性。方法共募集甲真菌病患者60名,总计223个病甲。患者随机分为A、B两组。其中A组患者病甲予超脉冲点阵CO2激光治疗,每两周1次,共6个月;B组患者病甲予每两周1次超脉冲点阵CO2激光治疗,联合每日1%卢立康唑乳膏外用封包于病甲8h,共持续治疗6个月。在治疗结束后3个月进行临床及真菌学评价。结果60例患者均完成治疗及随访,A组31例患者共计108个病甲,治疗结束后3个月临床有效率为50.9%,真菌清除率为38.9%;B组29例患者共计115个病甲,治疗结束后3个月临床有效率为69.6%,真菌学清除率为57.4%。B组临床有效率及真菌清除率均显著高于A组,差异有统计学意义（P〈0.05）。治疗结束后3个月,A、B两组患者满意度评价分别为87.1%和93.1%。两组治疗中,除激光治疗时出现轻微可耐受疼痛外,均无其他不良反应出现。结论超脉冲点阵CO2激光联合1%卢立康唑乳膏外用封包治疗甲真菌病是一种安全有效的方法,其疗效优于单纯点阵CO2激光治疗。

简介：选择60Coγ射线5Gy照射后第7天的人胚肺成纤维细胞(HELF),采用聚阳离子脂质体LipofectAMINE介导的基因转染法将人TGFβ1正、反义基因表达载体pMAMneo-TGFβ1和pMAMneo-AntiTGFβ1转入HELF,转染细胞经G418抗性筛选出来.提取培养细胞的染色体DNA,用DNA斑点印迹分析表明,它们能与neo基因特异杂交.用neo基因特异的PCR引物能从转染细胞扩增出276bp的阳性片段,而未转染细胞则扩增阴性.