简介:摘要目的优化和评估粪便和组织样本高通量测序前处理方法,提高高通量测序在宏病毒组研究中的灵敏度。方法针对粪便样本,选取经粪便排毒的5种病毒阳性样本混合模拟样本,对不同材质的滤器、核酸酶不同处理时间、不同的提取核酸方法进行评价。针对组织样本,选取动物组织中检出的2种病毒阳性样本,对过滤、核酸酶处理和不同的核酸提取方法进行评价。采用TaqMan real-time PCR定量方法评价每步处理对每一种模式病毒核酸载量的影响,采用SYBR Green real-time PCR方法对细菌16S rRNA基因和宿主12S rRNA基因进行定量以评价细菌和宿主的去除效果。结果对于粪便样本,使用0.22 μm的PES滤器过滤效果较好,使用PVDF材质滤器导致样本量减少;核酸酶消化2 h比消化1 h去除细菌的效果更好,且病毒损失较少;使用RPMK试剂盒可以有效减少细菌,但对部分病毒提取效果较差,而MVSK试剂盒提取病毒核酸效果较好。对于组织样本,使用0.22 μm的PES滤器过滤病毒损失较少;核酸酶消化1 h可以有效去除宿主gDNA,且病毒损失较少;使用VNAEK II试剂盒提取病毒核酸效果最好,Trizol LS+RPMK方法去除宿主gDNA效果较好,但病毒损失较大。粪便和组织样本的前处理方法整个流程的病毒损失分别为(1.7-3.0)Ct和(1.6-2.5)Ct。结论粪便样本最佳方法为PES滤器过滤、核酸酶消化2 h、MVSK试剂盒提取核酸;组织样本最佳方法为PES滤器过滤、核酸酶消化1 h、VNAEK II试剂盒提取核酸。
简介:本文依据2015年邹平县统计年鉴畜禽和农业用地统计数,根据畜禽粪便排泄系数和粪污含量,估测邹平县各镇办畜禽粪污产生量及分布情况。结果表明,邹平县2015年畜禽生产的粪便85.82万t,尿48.27万t,其中有机物18.72万t,总氮0.82万t,总磷0.43万t,钾0.52万t。不同畜禽中,牛的粪便排放量最高,占全县畜禽粪便总排放量的35.24%,其次是禽的粪便占29.65%,生猪粪便占25.89%。单位耕地面积畜禽粪便年负荷量平均为14.03t/hm^2,畜禽粪尿成分中N年负荷量平均为134kg/hm^2,P平均为71kg/hm^2,可为邹平县畜禽养殖合理布局和畜禽粪污的治理提供科学的依据。
简介:摘要社区卫生服务中心是基层医疗服务的主要承担者,在社区医生日常接诊小儿患者中,粪便异常是常见的小儿疾病之一。选择能够帮助社区医生简便、快速、准确的评估小儿大便情况的评估方法尤其重要。本文将对布利斯托小儿粪便评估量表进行介绍。为社区医生评估小儿大便情况提供参考。
简介:【摘要】目的:探讨粪便微生物检验在儿童腹泻诊断中的价值。方法:选取2018年2月至2021年2月我院临床88例腹泻患儿为研究对象,针对临床粪便标本微生物检验的阳性率进行评估,比较88例腹泻患儿病原菌检出情况、30例腹泻患儿病原菌药敏情况。结果:88例腹泻患者中病原菌检出阳性率人数总计30人,其中志贺菌15人(50%)、弧菌属2人(6.67%)、气单胞菌8人(26.67%)、其他菌种5人(16.67%)(P<0.05);30例腹泻患儿病原菌药敏情况中:志贺菌耐药性最强,其次为气单胞菌、其他菌种(P<0.05)。结论;经粪便微生物检验 , 志贺菌是导致儿童细菌性腹泻的主要病原菌 , 且有较强的耐药性。治疗过程中需根据患儿实际情况着重针对治疗。