简介:目的探讨储藏食物孳生粉螨群落结构及其多样性.方法用光照集螨法和水膜镜检法对采集样本进行粉螨分离,并对采集的粉螨进行分类鉴定、计数和数据分析.结果695份样本发现粉螨,阳性率为48.3%(695/1440),其中储藏干货的阳性率为55.4%(306/552),食用调料的阳性率为43.9%(158/360),海产食品的阳性率为35.8%(129/360),甜品的阳性率为60.7%(102/168).共检获粉螨23种,隶属于7科18属.不同月份储藏食物孳生粉螨群落参数不同,以6~8月粉螨群落参数数值较高.同时还发现不同种类储藏食物孳生粉螨群落参数也不同,储藏干货孳生粉螨的物种丰富度指数(Margalef指数=2.148)和多样性指数(H'=2.995)最高;食用调料孳生粉螨的均匀度指数(J=0.978)最高.结论储藏食物粉螨污染严重.同时温湿度及粉螨食性对储藏食物粉螨群落的组成和多样性起直接限制作用,应加强储藏食物管理,保护储藏食物品质,预防人体螨病.
简介:摘要目的分析河南省HIV感染者/AIDS病例(HIV/AIDS)肠道微生物群落结构的相关因素。方法在河南省采取方便抽样方法抽取122例抗病毒治疗和未抗病毒治疗的病例,采集全血和粪便标本。提取粪便样本的基因组DNA,采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序系统对16S rRNA的V3~V4高变区域进行测序。主要在菌群的属水平进行分析,选取丰度最高的30个属作为肠道微生物群落结构的衡量指标。使用冗余分析和Envfit函数对群落结构和各因素之间的相关性进行分析。结果本研究完成了122例病例的16S rRNA测序和分析,其基本情况为:平均BMI为(23.62±2.78)kg/m2,年龄(47±13)岁,男性占66.39%(81/122),以异性性传播为主要感染途径(51.64%,63/122),有36例(29.51%,36/122)病例未接受抗病毒治疗。在122例总人群病例样本中,前5位优势菌属是Prevotella、Roseburia、Megamonas、Bacteroides和Faecalibacterium。在86例接受抗病毒治疗的病例样本中,前5位优势菌属是Prevotella、Megamonas、Bacteroides、Roseburia和Faecalibacterium。在36例未抗病毒治疗病例样本中,前5位优势菌属是Prevotella、Faecalibacterium、Roseburia、Bacteroides和Megamonas。在总人群中,抗病毒治疗(P<0.001)是群落结构最显著的相关因素。其他显著因素有:确诊时间(P=0.009)、病毒载量(P=0.022)和HCV抗体(P=0.018)。抗病毒治疗与Megamonas呈正相关,与Prevotella、Roseburia和Faecalibacterium呈负相关,而确诊时间、病毒载量和HCV抗体 3个因素则与Prevotella、Roseburia和Faecalibacterium呈正相关,与Megamonas呈负相关。在未抗病毒治疗人群中,确诊时间(P=0.003)是与群落结构显著相关的因素。确诊时间与Roseburia、Faecalibacterium、Megamonas和Prevotella呈正相关,与Bacteroides呈负相关。结论抗病毒治疗和确诊时间是与肠道微生物群落结构显著相关的因素,并且对多个高丰度菌属有着重要影响。
简介:目的:利用PCR-DGGE指纹图谱技术对老年高血压患者口腔唾液微生物群落结构进行初步研究。方法:在65-80岁老年人中采集高血压伴慢性牙周炎患者、全身健康慢性牙周炎患者、口腔健康高血压患者和健康对照4组人群唾液,提取细菌总DNA,扩增后经DGGE指纹图谱分析其微生物多样性。结果:高血压伴慢性牙周炎患者与口腔健康高血压患者和健康对照组相比,其唾液微生物群落的丰富度(S)和Shannon指数(H’)显著降低(P〈0.05)。结论:菌群失调是老年高血压患者牙周炎发生发展的关键因素,良好的血压控制和口腔卫生保健是促进老年高血压人群口腔健康及全身健康的重要保障。
简介:摘要目的探讨特应性皮炎(AD)患者面部、上肢和背部皮损真菌群落多样性和结构特征。方法对2015年9 - 10月来自成都医学院第一附属医院皮肤科门诊的10例AD患者面部、上肢和背部皮损区和10例健康对照相应部位皮肤采样,提取样品DNA行MiSeq高通量测序,进行多样性指数分析、物种组成分析及主成分分析。两组间比较采用独立样本t检验,多组间均数比较采用单因素方差分析,两两组间多重比较采用LSD-t检验。结果多样性指数分析显示,AD患者组面部、上肢、背部皮损区样本Shannon指数均显著高于健康对照组相应区域(t值分别为2.67、2.37、3.34,均P < 0.05)。物种组成分析显示,马拉色菌属在AD患者组面部、上肢、背部皮损区和健康对照组相应区域样本中均占主要地位,其中球形马拉色菌和限制马拉色菌丰度合计约为80%。AD患者组总样本念珠菌属、曲霉属丰度显著高于健康对照组(t值分别为3.515、2.137,均P < 0.05)。AD患者组与健康对照组面部各主要真菌属丰度差异均无统计学意义(均P > 0.05);AD患者组上肢念珠菌属丰度显著高于健康对照组(t = 3.186,P < 0.05),背部曲霉属丰度显著高于健康对照组(t = 2.736,P < 0.05)。AD患者组、健康对照组面部、上肢、背部样本间主要真菌属丰度差异均无统计学意义(P > 0.05)。轻中重度AD患者组样本间各主要真菌属丰度比较,差异均无统计学意义(均P > 0.05)。主成分分析显示,AD患者组面部、上肢、背部皮损样本真菌群落未按病情严重程度聚类。结论AD患者面部、上肢、背部皮损区真菌群落多样性明显高于健康对照相应区域,马拉色菌为AD患者上述部位皮损和健康对照相应区域的优势菌种,AD患者皮损区样本中真菌群落组成与疾病严重程度可能无相关性。