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  • 简介:摘要目的探讨无创产前检测(NIPT)筛查胎儿染色拷贝变异(CNV)(主要为染色微缺失/微重复)的临床价值。方法选择2019年1月至2021年10月,于山西医科大学第一医院接受NIPT,结果提示胎儿染色缺失或重复,并接受介入性产前诊断的67例孕妇为研究对象。回顾性分析其临床病例资料。对孕妇羊水细胞进行胎儿染色核型分析及染色微阵列分析(CMA),并分析NIPT发现的胎儿染色CNV与上述介入性产前诊断结果的一致性。本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。所有孕妇对其上述检测均知情同意,并签署临床研究知情同意书。结果①于上述选择的时间段内,接受NIPT筛查的29 479例孕妇中,胎儿染色缺失或重复为87例,筛查结果胎儿染色CNV发生率为0.30%(87/29 479)。②介入性产前诊断的67例孕妇中,确诊胎儿染色CNV为35例,NIPT筛查胎儿染色CNV的阳性预测值为52.2%(35/67);29例胎儿的CMA与NIPT筛查结果显示的胎儿染色CNV基本一致,二者检测胎儿染色CNV符合率为43.2%(29/67)。结论NIPT筛查胎儿染色CNV具有可行性。对于NIPT筛查结果为胎儿染色CNV者,应采取产前诊断方法进一步确诊。

  • 标签: 染色体 无创产前检测 DNA拷贝数变异 产前诊断 微缺失 微重复 微阵列分析 孕妇
  • 简介:摘要目的探讨无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)对于胎儿染色拷贝变异(copy number variations, CNVs)的检测价值。方法收集18 661例接受NIPT检测的孕妇的临床资料,为提示胎儿携带CNVs的孕妇提供羊水染色核型或/及染色微阵列分析,并分析结果的一致性。结果在全部样本中,NIPT共提示21三58例、18三18例、13三19例、18/21三1例。88例孕妇接受了介入性产前诊断,59例的染色微阵列分析结果与NIPT一致,符合率为67.05%。NIPT还检出CNVs 37例,其中19例(微缺失15例、微重复4例)接受了介入性产前诊断,14例的验证结果与NIPT一致,符合率为73.68%。结论NIPT检测具有较高的灵敏度和准确性,对检测提示的CNVs应考虑进行介入性产前诊断,追溯其亲代起源,为临床提供指导。

  • 标签: 无创产前检测 染色体拷贝数变异 产前筛查 染色体核型 染色体微阵列分析
  • 简介:摘要目的探讨高通量测序技术对于除21、18、13等常见的染色非整倍体异常外染色拷贝变异检测的临床意义。方法选取自愿参与无创产前检测(non-invasive prenatal test,NIPT)的孕妇37 306例,对NIPT结果提示存在基因组拷贝变异(copy number variation,CNV)并愿意接受产前诊断的52例孕妇进行羊水穿刺,进行羊水细胞染色核型分析及染色微阵列芯片分析(chromosomal microarray analysis ,CMA),并对所有NIPT提示存在CNV的病例进行随访。结果在37 306份NIPT样本中共检测到CNV 78例,阳性率为2.09‰。其中52例孕妇行进一步产前诊断,共检出与NIPT结果较一致的拷贝变异15例,阳性率达28.85%。此外,对未进行诊断的26例孕妇进行了随访,其中自然流产2例,超声提示胎儿结构畸形后选择引产2例,新生儿多发畸形1例(CMA检测结果与NIPT较为一致),异常率高达19.23%,明显高于正常活产儿的异常率。结论NIPT提示胎儿拷贝缺失或重复是胎儿染色异常的高危指征,联合应用染色核型分析及CMA技术,可以简便、特异地检出大片段染色结构异常及CNVs,提高染色疾病的检出率,为遗传咨询和生育指导提供依据。

  • 标签: 无创产前检测 染色体核型分析 染色体微阵列芯片分析 拷贝数变异
  • 简介:摘要目的探讨颈部透明层(NT)增厚与胎儿染色拷贝变异(CNV)的相关性。方法对519例孕11周~13周+6产前超声检查提示NT增厚(NT厚度≥3.0 mm)的单胎胎儿行染色微阵列分析(CMA),并对总染色异常率(其中包含染色数目异常及CNV)进行分析;根据NT厚度分为:3.0 mm≤NT厚度<3.5 mm、3.5 mm≤NT厚度<4.0 mm、4.0 mm≤NT厚度<5.0 mm及NT厚度≥5.0 mm,分别对染色异常率进行分析。结果(1)总染色异常率为25.6%(133/519),其中染色数目异常率为21.2%(110/519),致病性CNV(pCNV)共16例,检出率为3.1%(16/519)。(2)不同NT厚度胎儿的染色异常率、染色数目异常率分别比较,差异均有统计学意义(P<0.01),而pCNV检出率差异无统计学意义(P>0.05)。(3)共检出16例pCNV,其中有3例涉及X染色大片段缺失或重复,可能表现为“Turner综合征”症状;2例(例3和8)涉及18号染色大片段缺失或重复,分别为“18p四”嵌合体和18p缺失综合征;3例分别涉及2、5、11号染色大片段缺失或重复;另8例pCNV则为亚显微结构水平的微缺失或微重复。结论胎儿染色异常风险随NT厚度增加而增加,但pCNV与NT增厚的程度无明显相关性;涉及染色片段性非整倍体异常的pCNV可能与NT增厚表型有关。

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  • 简介:摘要目的探讨高通量基因测序检测染色拷贝变异(copy number variation sequencing, CNV-seq)与染色核型分析在产前诊断中联合应用价值。方法收集2016年1月至2018年12月在枣庄市妇幼保健院进行产前诊断的905例羊水标本的G显带核型分析和CNV-seq结果,并对CNV-seq提示可疑致病性或临床意义未明的拷贝变异(copy number variants, CNVs)进行变异来源的亲本分析。结果除罗氏易位引起的染色数目异常外,CNV-seq对G显带核型分析确诊的70例染色数目异常,9例染色嵌合体异常和7例染色非平衡性结构异常均成功确诊并且额外多发现10例致病性明确的染色微缺失/微重复。CNV-seq与G显带核型联合使用能将染色异常阳性率从11.27%(102/905)提高到12.38%(112/905)。对33例存在可疑致病性CNVs或临床意义未明CNVs (variats of uncertain significance, VUS)胎儿样本的亲本验证分析表明,81.82% (27/33)的胎儿可疑致病性CNVs或VUS源于父母遗传,仅有18.18% (6/33)源于新发变异。结论CNV-seq与G显带核型联合使用能多发现1.11%的致病性明确CNVs,可以有效减少G显带核型分析无法检测的染色微缺失/微重复综合征缺陷儿的出生。同时,对可疑致病性CNVs和VUS进行父母亲本家系验证有助于确定CNVs的来源和遗传咨询。

  • 标签: 产前诊断 G显带核型分析 高通量基因测序 染色体拷贝数变异
  • 简介:摘要目的探讨胎儿心脏结构异常与羊水染色非整倍体及拷贝变异(copy number variation,CNV)的相关性。方法对328例孕妇进行胎儿超声检查及染色微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA),根据胎儿的心脏结构将其分为正常组(n=273)与异常组(n=55),比较两组染色非整倍体和CNV的检出情况,采用Spearman法分析二者与胎儿心脏结构异常的相关性。结果异常组染色非整倍体和CNV的检出率显著高于正常组(P<0.05);胎儿心脏结构异常的发生率与染色非整倍体及CNV明显相关(P < 0.05)。结论胎儿染色非整倍体及CNV与心脏结构异常存在明显的相关性。

  • 标签: 染色体微阵列分析 胎儿心脏结构异常 染色体非整倍体 拷贝数变异 相关性
  • 简介:摘要目的评估低深度全基因组拷贝变异测序技术(copy number variation sequencing, CNV-seq)在胎儿肠管回声增强(echogenic fetal bowel, EB)孤立型及合并其他超声软指标(合并型)中的诊断价值及遗传病因分析,为临床遗传咨询提供指导。方法以2017年12月至2021年6月就诊于本中心共163例为研究对象。采集羊水(162例)或绒毛(1例)进行CNV-Seq检测,结合生物信息学分析其致病性CNVs情况。结果163例中共检出13例(8.0%)阳性,包括9例(5.5%)非整倍体及4例(2.4%)CNVs。其中孤立型EB组和合并型EB组阳性率分别为1.7%(1/58)和11.4%(12/105),经卡方检验,两者存在显著差异(P<0.05)。两组中各发现一例Xp22.1重复,为女性DMD携带者,后健康出生。合并型EB组中发现9例非整倍体及2例致病性/疑似致病性CNVs,均引产。结论合并型EB胎儿的非整倍体及致病性CNVs阳性率远高于孤立型EB,且大部分终止妊娠。这提示在临床上相对于孤立型EB,需要更加关注合并型EB胎儿,及时进行产前诊断及遗传咨询。

  • 标签: 肠管回声增强 基因组拷贝数变异 低深度全基因组拷贝数变异测序
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  • 简介:摘要目的探讨基于下一代测序技术的基因组拷贝变异测序(CNV-seq)联合染色核型分析技术在产前诊断中的应用价值。方法将2019年1月至2020年6月在大连市妇女儿童医疗中心进行产前诊断的329例孕妇的羊水标本送检进行染色核型分析,同时行CNV-seq检测,比较两种方法的检测结果。结果CNV-seq联合染色核型分析技术共检出异常染色53例,异常检出率为16.11%(53/329),其中26例检测结果一致,分别为22例非整倍体、2例结构异常以及2例嵌合体;CNV-seq检出23例核型分析漏检的染色拷贝变异(CNVs),包括17例微缺失、6例微重复;染色核型分析检测出4例CNV-seq漏检的染色结构异常,包括3例平衡易位、1例倒位。结论CNV-seq在检测微小CNVs片段方面具有明显优势,可弥补核型分析在分辨率方面的不足;CNV-seq联合染色核型分析可以提高异常染色检出率,对产前诊断具有重要的 意义。

  • 标签: 产前诊断 核型分析 基因组 拷贝数变异测序
  • 简介:摘要目的探讨染色微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术中的亲缘分析在判断基因组拷贝变异(copy number variations,CNVs)临床意义中的作用。方法本研究为回顾性研究。收集2017年11月至2019年12月在北京大学第一医院实验中心行产前诊断的73例核心家系的临床资料。检测指征包括超声异常54例(其中伴颈部透明层厚度≥2.5 mm 12例,胎儿生长受限4例,既往不良孕产史7例,单纯超声异常31例),无创产前基因检测高风险4例,高龄妊娠9例,单纯既往不良孕产史3例,胎死宫内2例,孕妇智力障碍1例。使用基因组DNA提取试剂盒提取羊水细胞、绒毛、脐血、胎儿组织和胎心血DNA。采用基于微阵列的比较基因组杂交技术和单核苷酸多态性微阵列技术分析73例产前样本CNVs。取孕妇及其丈夫(必要时相关亲属)外周血DNA做相同检测。总结CMA亲缘检测结果。采用描述性统计分析。结果73例样本共检出76个CNVs,其中检出9个致病性CNVs,经过亲缘检测分析后6个为新发变异,2个母源,1个父源;检出6个可能致病性CNVs,3个为新发变异,2个母源,1个父源;检出20个临床意义不明的CNVs,5个父源,3个母源,其余12个为新发变异;41个可能良性CNVs,其中38个来自表型正常的父母。结论产前诊断时亲缘分析对胎儿CNVs的临床意义解读有重要意义,可以帮助判断CNVs的临床意义和再生育风险。

  • 标签: 染色体 微阵列分析 DNA拷贝数变异 双亲
  • 简介:摘要目的探讨基于下一代测序技术的基因组拷贝变异测序(CNV-seq)联合染色核型分析技术在产前诊断中的应用价值。方法将2019年1月至2020年6月在大连市妇女儿童医疗中心进行产前诊断的329例孕妇的羊水标本送检进行染色核型分析,同时行CNV-seq检测,比较两种方法的检测结果。结果CNV-seq联合染色核型分析技术共检出异常染色53例,异常检出率为16.11%(53/329),其中26例检测结果一致,分别为22例非整倍体、2例结构异常以及2例嵌合体;CNV-seq检出23例核型分析漏检的染色拷贝变异(CNVs),包括17例微缺失、6例微重复;染色核型分析检测出4例CNV-seq漏检的染色结构异常,包括3例平衡易位、1例倒位。结论CNV-seq在检测微小CNVs片段方面具有明显优势,可弥补核型分析在分辨率方面的不足;CNV-seq联合染色核型分析可以提高异常染色检出率,对产前诊断具有重要的 意义。

  • 标签: 产前诊断 核型分析 基因组 拷贝数变异测序
  • 简介:摘要目的探讨染色微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)技术在颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚胎儿拷贝变异(copy number variation,CNV)分析中的价值。方法将2018年9月至2019年7月在宁波产前诊断中心筛查NT并行染色核型及CMA检测的180例胎儿(单胎)纳入研究。根据NT值分组。结果180例中共检出染色异常43例,其中核型异常33例。147例核型正常胎儿中,CMA额外检出10例CNV异常,其中6例(4.1%,6/147)为致病性或可能致病性。5组不同NT值胎儿染色异常检出率比较,≥5.5 mm组异常发生率显著增高(P<0.05)。结论CMA可在核型正常胎儿中进一步检出6.8%的异常CNVs;NT增厚程度与孕妇年龄无关,NT≥5.5 mm染色异常发生率显著增高;致病性变异可出现在不同NT增厚程度中,NT≥2.5 mm即可建议行CMA检测。

  • 标签: 颈项透明层厚度 染色体微阵列分析 拷贝数变异 染色体异常
  • 作者: 史吉平 谭评 李金明 张瑞
  • 学科: 文化科学 >
  • 创建时间:2021-05-08
  • 出处:《中华医学杂志》 2021年第15期
  • 机构:北京大学第五临床医学院 北京医院 国家老年医学中心 国家卫生健康委临床检验中心 中国医学科学院老年医学研究院,北京 100730,北京医院 国家老年医学中心 国家卫生健康委临床检验中心 中国医学科学院老年医学研究院,北京 100730
  • 简介:摘要目的了解我国无创产前检测(NIPT)胎儿染色拷贝变异(CNVs)的总体情况、检测范围、检测试剂和临床性能。方法国家卫生健康委临床检验中心设计NIPT检测CNVs相关调查问卷,内容包括调查实验室是否已开展NIPT检测CNVs项目以及实验室开展该项目的检测范围、试剂/平台、预期用途、筛查人群及临床性能。在2020年10月将调查问卷发放至全国31个省、自治区、直辖市的355家实验室,并对回报结果进行统计分析。结果228家实验室已开展NIPT检测CNVs项目,共计116种CNVs类型,以5p15缺失、22q11.2缺失、1p36缺失和15q11.2缺失的检测比例最高,均超过95%。所采用的检测试剂均为实验室自配试剂,且基于大规模平行测序的原理,最低测序数据量为3~15 M测序读段(reads),胎儿分数检测下限为3%~5%,可检出的最小片段长度为1~5 Mb。实验室将CNVs检测应用于日常开展、根据患者自愿要求开展和科学研究的比例分别为58.8%(134/228)、57.5%(131/228)和20.6%(47/228)。134家实验室全部或部分清楚NIPT检测相应微缺失/微重复综合征的临床性能,实验室对Cri du Chat综合征、22q11.2缺失综合征、1p36缺失综合征和Angelman综合征检测宣称的敏感度范围为50.0%~100%、60.0%~100%、50.0%~100%和33.3%~100%,阳性预测值范围为9.0%~50.0%、18.0%~100%、20.0%~30.0%和20.0%。结论我国实验室开展NIPT检测CNVs有待规范化,实验室应依据指南检测临床意义明确的CNVs,做好试剂性能确认工作,在掌握临床性能的情况下开展检测和提供结果解释。

  • 标签: 产前诊断 染色体拷贝数变异 临床应用
  • 简介:摘要目的探讨无创产前检测(non-invasive prenatal testing, NIPT)检出胎儿拷贝变异(copy number variations, CNVs)的临床价值。方法2015年1月1日至2018年9月1日在广东省妇幼保健院行NIPT的孕妇37 845例,除常规染色数目异常外检出205例CNVs,纳入回顾性分析。205例检出CNVs的孕妇中137例接受了介入性产前诊断。随访妊娠结局。分析NIPT对于CNVs的检测效能。采用描述性统计分析。结果NIPT对CNVs的检出率为0.54%(205/ 37 845),110例经产前诊断未发现染色核型异常,2例产前诊断结果与NIPT检出CNVs不符,25例产前诊断结果与NIPT一致。NIPT筛查CNVs的阳性预测值为18.2%(25/137),灵敏度为100.0%(25/25),特异度为99.7%(37 625/37 737)。27例产前诊断结果异常孕妇中5例失访,8例引产终止妊娠,14例活产且新生儿表型正常。110例产前诊断未发现异常孕妇中87例足月分娩,其中2例存在卵圆孔未闭,余85例新生儿表型正常;3例早产;1例孕28周+2因子痫前期终止妊娠;另有2例难免流产;2例孕妇要求引产;15例失访。结论常规NIPT对于胎儿CNVs具有一定的检测效能,但阳性结果须结合介入性产前诊断结果、超声随访结果等进行详细的遗传咨询。

  • 标签: 染色体畸变 DNA拷贝数变异 产前诊断
  • 简介:摘要冠心病是一种由遗传和环境因素共同作用所致的复杂性疾病,是全球范围内致死、致残的首要原因。前期以单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)为基础的全基因组相关分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)在冠心病遗传易感性领域取得巨大的突破,但仍不能对冠心病遗传性做出完整的解释,基因拷贝变异(copynumbervariations,CNVs)逐渐引起学者重视。本文将对近期冠心病CNVs研究所取得的重要进展进行综述,简要分析仍存在的不足及发展趋势,为进一步研究冠心病遗传机制提供线索。

  • 标签: 冠心病 遗传易感性 基因拷贝数变异 单核苷酸多态性
  • 简介:摘要婴儿痉挛症(ISs)是一种年龄相关的癫痫性脑病,与认知障碍、孤独症谱系障碍及精神运动发育迟缓高度相关。目前已发现多种遗传方式,如染色异常、拷贝变异(CNVs)、单基因病等均可导致ISs,其中CNVs或结构性染色重排在ISs的发病机制中起重要作用。现就CNVs与ISs的研究进展进行综述,以期为深入研究ISs发病的分子机制和遗传基础提供参考。

  • 标签: 婴儿痉挛症 West综合征 癫痫性脑病 拷贝数变异
  • 简介:罗氏NimbleGen已与韩国疾病控制与预防中心(KCDC)和Macrogen,Inc.公司签署合作协议,将共同实施一项针对韩国人的为期8个月的高密度CNV研究。该研究分为两个阶段,包括对韩国人口的大规模CNV特征描述,并对包括糖尿病在内的复杂疾病的基因相关研究中常见的CNV进行分析。

  • 标签: 韩国人 拷贝数 变异 Inc.公司 疾病控制 合作协议
  • 简介:【摘 要】基于人教版高中生物教材必修2中染色变异与减数分裂的知识链接呈现的难点,文章从染色结构变异的来源清楚地解释了各种染色结构变异的不同,并通过采用同源染色对比图示直观展示了各种类型的染色结构变异,便于理解。

  • 标签: 染色体变异 缺失 重复 易位 颠倒
  • 简介:摘要:目的 探究扩展性无创产前基因检测技术(NIPT)在胎儿染色拷贝异常筛查中的价值与应用。方法 本文以纳入与排除原则,选自2016年1月至2021年6月在产科门诊进行扩展性无创产前基因检测的单胎妊娠孕妇(8582例)为研究对象,采用NIPT检查基因染色拷贝变异(CNV)情况,并对胎儿染色类型阳性率、阳性类型及阳性预测值作出分析。结果 经染色核型和随访问“金标准”,显示582例胎儿染色拷贝异常,其中染色非整倍体为405例,占比(69.56%),染色微重复或缺失为208例,占比(35.72%)。讨论 扩展性无创产前基因检测的临床应用将有助于降低出生缺陷发生,提升出生人口素质。

  • 标签: 无创产前基因检测技术 染色体拷贝数异常 特异度
  • 简介:摘要目的应用低深度高通量全基因组拷贝变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术分析颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚胎儿的遗传学病因,初步探讨胎儿NT增厚与染色异常的关系。方法回顾性收集2018年1月至2020年12月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心进行CNV-seq检测的487例NT增厚胎儿的资料,根据胎儿NT厚度分为≥3.0~<3.5 mm组(n=129)和≥3.5 mm组(n=358)。采用χ2检验或Fisher精确概率法对染色异常分布情况及2组染色异常率进行分析。结果487例NT增厚胎儿中,共检出染色异常126例(25.9%),其中染色非整倍体107例(22.0%),致病/可能致病拷贝变异(copy number variation,CNV)19例(3.9%)。NT≥3.5 mm组胎儿的非整倍体检出率高于NT≥3.0~<3.5 mm组[14.0%(18/129)与24.9%(89/358),χ2=6.58,P=0.010]。而2组胎儿致病/可能致病CNV检出率比较,差异无统计学意义(χ2=0.30,P=0.584)。结论NT增厚胎儿染色非整倍体发生风险随NT厚度的增加而增加,致病/可能致病CNV发生风险与NT增厚程度无关,但因样本量较少,需进一步验证。CNV-seq可用于NT增厚胎儿遗传学病因的检测。

  • 标签: 颈部透明带检查 染色体畸变 DNA拷贝数变异 高通量核苷酸序列分析