简介:【摘要】目的:分析某中心 2019年 1月~ 6月仿制药生物等效性试验中,受试者筛选失败的原因,并针对原因探讨提高筛选成功率的对策。方法:分析某中心仿制药生物等效性试验的 1456例健康受试者筛选过程,对筛选失败的原因进行归纳总结。针对原因和影响因素,制定对策提高筛选成功率。结果:与受试者筛选失败有关的因素包括身份鉴定、既往史、体格检查、身高体重测量、生命体征测量、实验室检查和依从性等,其中实验室检查不合格,占 34.40%;生命体征测量不合格,占 14.15%;既往史询问和身高体重测量也各占 11.23%和 9.40%。结论:实验室检查不合格、生命体征测量不合格、既往史不合格、身高体重不合格是受试者筛选失败的主要原因。可从规范受试者来源、加强教育、数据库查重,强化单独知情同意过程,制定科学的正常值参考范围等方面提高受试者的筛选成功率。
简介:摘要:食物中含有丰盛的营养成分,这些成份易导致微生物大批的生长与滋生,从而致使食品的营养成分降低或者质量下降,最终致使食品的腐败和变质[1]。防止腐烂变质,保留食物本身的品质与营养价值可使用食品防腐剂,它是通过抑制食物中微生物滋生与繁殖的方法来延长食品的储存时间[2]。目前在我国防腐剂市场上,化学防腐剂占有很大比重,但目前不能确保化学防腐剂不会对人体产生一些毒副作用,因此天然、绿色、安全的生物防腐剂将是未来人们食品中主要的趋势,并将逐步取代传统的化学防腐剂[3]。因此,本试验是通过从土壤中提取分离出对农业病菌有拮抗作用的菌株,进而寻求天然的食品防腐剂,为食品防腐剂在食品工业上的发展奠定一定的基础。
简介:摘要目的通过生物信息学方法筛选与肺腺癌脑转移相关的关键枢纽基因,为寻找潜在生物标志物及治疗靶点提供依据。方法通过检索GEO数据库获取肺腺癌原发灶(GSE10072)及脑转移灶(GSE14108)的基因芯片数据,经R软件筛选差异表达基因(DEGs)并利用clusterProfiler软件包进行DEGs的GO功能注释及KEGG代谢通路分析。利用STRING数据库联合Cytoscape软件进行蛋白互作(PPI)网络分析以筛选关键枢纽基因,并通过Ualcan在线分析工具中的TCGA数据库进行预后分析,以及GSEA分析GSE41271中183例肺腺癌标本,探讨关键基因在调控肿瘤侵袭转移中的应用价值。结果共筛选出298个DEGs,其中51个基因表达下调,248个基因表达上调。GO功能分析和KEGG代谢通路分析结果显示,这些基因主要涉及细胞外基质组成、体液免疫反应、趋化因子及其受体,并主要富集在泛素介导的蛋白水解、趋化因子信号通路等。PPI分析筛选出8个枢纽基因,其中KLHL5为潜在的肺腺癌脑转移新预测生物标志物。进一步分析表明KLHL5高表达组肿瘤侵袭转移相关通路显著富集,且与肺腺癌患者预后不良相关。结论细胞外基质的生物作用、趋化因子信号通路以及8个关键枢纽基因可能成为抑制肺腺癌脑转移的潜在治疗靶点。
简介:摘要目的应用生物信息学方法筛选和分析儿科脓毒症关键基因。方法从GEO数据库中下载2015年2月19日上传的儿科脓毒症芯片数据集GSE66099和2020年2月13日上传的儿科脓毒症芯片数据集GSE145227,使用Limma包筛选儿科脓毒症与正常对照组血液组织差异表达信使核糖核酸(DEmRNA),随后进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用在线网站STRING和Cytoscape软件对DEmRNA构建蛋白互作网络(PPI),并筛选关键(hub)基因。最后使用R软件进行hub基因差异表达和受试者工作特征曲线(ROC曲线)分析。结果共发现160个DEmRNA,包含126个上调mRNA和34个下调mRNA。通过GO功能富集分析,发现DEmRNA主要富集在中性粒细胞激活和脱粒,T细胞激活以及淋巴细胞活化调节。KEGG富集通路分析显示DEmRNA主要参与自然杀伤细胞介导的细胞毒性和中性粒细胞胞外陷阱的形成。STRING和Cytoscape共筛选出10个hub基因,通过R软件分析发现10个hub基因(ARG1、RETN、MMP9、C3AR1、LCN2、FPR2、CCL5、CEACAM8、ELANE和DEFA4)在儿科脓毒症中具有显著的差异表达,同时每个hub基因的ROC曲线下面积均>0.7,具有较好的诊断价值。结论通过生物信息学分析获得10个hub基因在儿科脓毒症疾病进展中发挥重要作用,并为儿科脓毒症诊断、预后标志物和潜在治疗靶点提供了新的理论依据。
简介:摘要:生物等效性试验包括试验准备阶段(临床开始前准备、临床研究启动、),试验进展阶段(招募、筛选入选、入住、给药观察、出院发放补偿金),试验结束阶段(关闭中心、总结),每个过程中都可能出现质量问题。试验进展阶段的质量控制对试验的安全性和有效性有着直接影响,而招募的受试者经过筛选后入选是生物等效性试验进展阶段的第一步。
简介:摘要目的通过生物信息学方法探索与白癜风进展相关的信号通路和基因。方法从GEO数据库中下载白癜风芯片检测数据集GSE75819,利用R语言软件中limma包的LMFit和eBayes函数筛选15例印度白癜风患者皮损与非皮损组织间的差异表达基因(DEG)。通过京都基因与基因组数据库(KEGG)、基因本体论(GO)分析和基因集富集分析(GSEA)评估DEG的富集途径和功能。通过蛋白-蛋白相互作用网络从DEG中筛选中心基因。2019年1 - 6月于新疆维吾尔自治区维吾尔医医院收集8例汉族寻常型白癜风患者皮损及非皮损皮肤组织标本,采用实时定量PCR法验证上述上调及下调差异最大的10个DEG的表达。结果与15例非皮损组织相比,在15例白癜风皮损组织中共发现148个DEG,其中KRT9、CXCL10、C8ORF59、TPSAB1、RPL26为前5位上调基因,SILV、RPPH1、TYRP1、MLANA、LOC401115为前5位下调基因,且经实时定量PCR在8例汉族白癜风患者皮损及非皮损组织中验证。GO分析显示,DEG主要富集于翻译起始、细胞对脂多糖的反应、核糖体、核糖体亚基和核糖体的结构组成等。KEGG通路分析显示,DEG主要富集于酪氨酸代谢、PPAR信号通路、氧化磷酸化和Toll样受体信号通路。蛋白-蛋白相互作用分析筛选出UPF3B、SNRPG、MRPL13和RPL26L1 4个中心基因。结论KRT9、CXCL10、C8ORF59、TPSAB1、RPL26、SILV、RPPH1、TYRP1、MLANA及LOC401115可能作为白癜风潜在的诊断标记分子和治疗靶点。