简介：为研究黄金茶出芽早的分子机制，本研究采用SMART-RACE技术，获得了与解除休眠相关的转录因子CsDAM2基因的全长eDNA序列，并进一步对该氨基酸序列进行了生物信息学分析。研究发现CsDAM2基因全长为1386bp，序列分析表明，该序列含有一个完整的编码区，大小为657bp，编码区GC含量为50．45％。此编码区可以编码分子量为24．86kD的亲水性蛋白，该蛋白由218个氨基酸组成，理论等电点（pI）为8．96。黄金茶CsDAM2蛋白有11个磷酸化位点，属跨膜蛋白，与毛白杨DAM3的相似性为71％，与已登录茶树MADS．box蛋白的一致性为35％。本研究为进一步揭示黄金茶春芽萌发早的分子机制提供了理论依据。

简介：为研究优质烟叶的分子基础,以翠碧一号不同生长时期的叶片为材料,CTAB法提取总RNA,利用SMART技术合成全长cDNA,之后按经修改的Clontech技术成功构建了烟草叶片全长cDNA文库。经鉴定,初级文库库容为3.85×10^6个克隆,重组率为100%,重组子插入片段集中在750-2000bp之间。随机挑取25个克隆测序后,经生物信息学分析表明,烟草上已经报道的基因占10条,11条为全长基因序列;20条序列有功能注释。综合分析表明,所构建的文库质量较高,达到了基因的分离、筛选和克隆的建库目的。

简介：硬酯酰辅酶A脱氢酶（Stearoyl-CoADesaturase,SCD）是参与脂肪酸脱氢反应的限速酶和关键酶,此酶编码基因SCD对增加膜磷脂的不饱和脂肪酸成分,提高细胞膜在低温下的流动性发挥重要作用,可能是抗寒过程中的关键基因成员。本研究采用cDNA末端快速扩增技术（RapidAmplificationsofcDNAEnds,RACE）克隆了鲤（Cyprinuscarpio）脑组织CcSCD基因的全长cDNA序列,采用实时荧光定量PCR技术检测该基因在低温（6℃）和常温（23℃）条件下的转录表达差异,对其蛋白编码序列的结构和功能进行了预测分析。结果显示,CcSCD基因cDNA全长2618bp,包含一个由324个氨基酸残基组成的长度为975bp的阅读框（ORF）;蛋白分子进化树显示鲤的SCD和草鱼（Ctenopharyngodonidella）的SCD蛋白同源性最高,相似性达88%;实时荧光定量结果表明,低温刺激下（6℃）,CcSCD基因表达水平是常温条件下（23℃）的13.9倍,差异非常显著（P〈0.01）。本研究旨在为今后构建表达载体,通过遗传操作等研究手段鉴定其抗寒功能奠定基础。

简介：启动子是调控外源基因在植物体内表达的“开关”。随着植物转基因技术的广泛应用，无论是基础研究还是应用研究，人们希望能够充分利用启动子来准确控制外源基因在植物体内的表达，使目的基因的“开”和“关”、表达的“多”和“少”、在“何地”和“何时”表达等。能够听从人的指挥，以实现植物育种的分子设计。因此，快速分离和鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究的热点和难点。本文在互补末端连接反向PCR（CELI—PCR）技术基础上建立起…种快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列的新方法。该方法利用CELI—PCR进行染色体连续步移，获取足够长的目的基因及其上游基因组DNA序列，再根据转录起始位点是目的基因转录本和启动子的分界点，其下游转录本中的外显于可通过RT-PCR扩增，而上游启动子序列则不能被RT-PCR扩增这一特点，借助RT-PCR进行cDNA连续步移，直到获得全长cDNA，确定启动子基因5’非翻译区的位置，进而精确定位转录起始位点。从而获取目的基因准确的启动子序列和全长cDNA序列。因此，建立在CELI，PCR基础上的RITIS技术，可绕过繁琐的构建cDNA库和5＇-RACE等方法快速分离目的基因全长cDNA和启动子序列。

简介：对木头开发和形成的分子的生物研究是相关基因的发现的最近的年，而是步里的焦点，他们在木头性质的控制的函数是慢的。它在另外的工具上的高产量能力，敏感，和可靠性的优点为调查能够的基因表示patternsis开发了的microarraytechniquewith很快assaying几千基因。在这研究，从开发白杨木部纸巾的二个cDNA图书馆准备的cDNAmicroarray从Populusdeltoides的主要的茎在不同高度在不成熟的木部纸巾习惯于试金基因表示模式(15?岁)，它被证实有不同木头性质(microfibrillar角度，木质的密度)旁边X光检查。有在薄片之间的微分表示侧面的274个抄本外面被屏蔽，并且单个克隆受到5定序。用生物信息的分析，我们识别了可以影响白杨木头性质的候选人基因，许多哪个属于各种各样规章并且信号transduction基因家庭例如锌手指蛋白质抄写因素，DNA有约束力的抄写因素，乙烯反应因素等等。结果建议这些基因可以调整涉及木头形成的酶。进一步的工作将被执行克隆这些基因并且决定他们怎么影响白杨木头性质。

简介：FemaleinflorescenceofBetulaplatyphyllawassampledatanintervalofeachtwodaystoanalyzethebackgroundofgeneexpressioninfloralphase.OnthebasisofSMARTstrategy,thedrivercDNAwasobtainedfromtotalRNAofthelastsampleandthetestercDNAwasfromthatoftheothersbyRT-PCRwhichweresubsequentlyusedtoconstructasubtractedcDNAlibrary.TheresultoftheESTs(expressionsequencetags)blastXshowedthatthegenesinthesubtractedcDNAlibrarycouldbemainlyclusteredinto5groupsrelatedtometabolism,transportationandsignaltransduction,cellcycle,stressresponse,andregulation.Therelationshipbetweengeneexpressionanddevelopmentwasalsodiscussed.

简介：Throughexploitingthehighhomologyofcerealcropgenes,membranouscDNAmicroarrayscontaining3311uniquericetranscripts(including1639cndosperm-derivedtranscriptsand1672maturestem-derivedtranscripts)wereusedformonitoringtheexpressionprofilesofl-leafstageseedlingsof4cerealcropspecies:rice,maize,sorghumandbarley.Afterhybridizingwith[P]labeledprobes,73.6%ofthearrayedgenesgeneratedreliablesignalsinallofthefourcerealcrops.Furtheranalysisrevealedthatamongthearrayedgenes,ahigherpercentageoftheendosperm-derivedtranscripts(86.6%)expressedthanthatofthematurestem-derivedgenes(60.9%),indicatingthatmostoftheendospermexpressedgenesfunctionedinyoungseedlingswhilcconsiderableamountofmaturestemtissueexpressedgenesdidnotexpress.Theseresultsalsoinferredthatsomegenesmightfunctiononlyatcertaindevelopmentalstages.Bycomparingtheobtainedprofdes,84geneswereidentifiedconstantlyexpressedinallthefourcerealcrops.Manyhousekeepinggenes,suchaspolyubiquitin,ubiquitinconjugatingenzymeandribosomalproteinswereincludedinthiscatalogue.Theexperimentalsoidentified14riceseedlingspecificallyexpressedgenes,including3bioticandabioticstressinducedgenesand1apoptosissuppressorencodinggeneBaxinhibitor-1.Thisinvestigationprovidedinvaluableinformationforcomparativegenomicsofgramineaemembers.

简介：Twostarch-branchingenzyme(SBE)inrice,isknowntobeakeyenzymeinamylopectinbiosynthesis.ThecDNAoftwoSBE(starch-branchingenzyme)genesSheIandShedencodingSBEⅠandSBEⅢ(twomajorisoformsinrice)wereclonedbyanimprovedRT-PCRtechnique,fromatemplatecDNAlibray,derivedfromthetotalmRNAsextractedfromtheimmatureseedsofajaponicariceWuyunjing7.DNAsequenceanalysisshowedthatthesizeoftheclonedSheIandShedcDNAswere2490and2481bplong,respectively,includingtheirentirecodingsequences.ComparisonanalysisindicatedthatthenucleotidesequenceofShe3wasthesameasthatofshed(GenbankAccessionNo.D16201)asreportedpreviously.Therewereonlyfourbase-pairsdifference,whichresultedinchangesoftwodeducedaminoacidsbetweentheclonedShe1cDNAandthereportedshe1(GenbankAccessionNo.D11082).TheclonedSheIandShedcDNAsmakeitpossibletoimprovericestarchqualitythroughgeneticengineering.

简介：本文利用SPSS分析软件对1530尾大鲵的全长与体重数据进行了回归分析。结果表明，体重与全长之间存在极显著的相关关系，体重与全长之间的关系主要表现为幂函数关系，其关系式为：Y=0．010X2。

简介：本研究以高抗大白菜芝麻状斑点病品系‘C24’和高感品系‘03B9’为试验材料,利用cDNA-AFLP技术分析其在发病条件（高氮）和不发病或少发病条件（低氮）下基因表达的差异,并回收得到与大白菜芝麻状斑点病相关的差异表达转录衍生片段（Transcript-derivedfragment,TDF）19条。研究结果表明：12个TDF与NCBI或BrassicaDatabase已有序列同源,功能涉及激素调节、氧化还原酶、细胞结构、蛋白质分解、信号传导等;3个TDF在NCBI或TIGR上有序列同源,但是功能未知;4个TDF未找到同源序列。结合本课题组有关氮素浓度和形态对大白菜芝麻状斑点病影响的生理指标的研究结果,可推测大白菜芝麻状斑点病可能是细胞结构受到破坏,细胞膜上细胞信号跨膜转导受阻,ACC、ABA的调节,蛋白质的降解,PPO引起酚类物质褐变等共同作用所致。

简介：Thelight-harvestingchlorophylla/b-proteincomplexplaysanimportantroleinphotosynthesisofplants.Afull-lengthcDNAoflight-harvestingchlorophylla/b(cab)genewasclonedfromthefirststrandofMoso(Phyllostachysedulis)cDNAthroughRT-PCRandRACEmethods,namedascab-PhE10(cabgene10fromPh.edulis).Thelengthofcab-PhE10(GenBankaccessionnumber:EU118754)is1151bp,whichcontainsanopenreadingframeencoding283aminoacidsfrom81stto932ndposition.Thebioinformaticsanalysisindicatedthattheproteinencodedbycab-PhE10hadachlorophlla/bbindingdomain(83rd-247thposition),twoproteinkinaseC-phosphorylationsites,threeN-myristoylationsitesandayiaA/Bdoublehelixdomain.Theaminoacidsequenceofcab-PhE10showedhighsimilaritywiththecabgenesofOryzasativa,Zeamays,Hordeumvulgare,andVitisvinifera,morethan80%,respectively,whichindicatedthatcab-PhE10genebelongstolhcb5genefamily.

简介：转录组连接基因组遗传信息与蛋白质组,也是基因功能研究的基础和出发点。单分子测序技术是近年逐渐成熟的新一代测序技术,也称为第三代测序技术,在转录组学研究方面较前代测序技术具有独到优势,应用前景广阔。在非模式植物的功能基因组学研究中,全长转录本的获得可有力地推进相应基础研究水平,而第三代测序技术为此提供了较好的解决方案。本研究就目前技术较为成熟且应用较广泛的SMRT等单分子测序技术原理进行了介绍,综述了该技术在非模式植物转录组学研究中的应用现状,对其应用前景进行了展望。

简介：为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94的杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合的6个农艺性状的杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状的贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行cDNA-SRAP差异表达分析,并对差异表达片段进行克隆测序分析。结果表明：超高亲优势表现为株高〉叶数〉叶厚〉叶长〉叶宽〉叶面积;中亲优势表现为株高〉叶数〉叶面积〉叶长〉叶宽〉叶厚。叶面积和叶长、叶宽,叶长与叶宽呈极显著相关。主成分分析将6个农艺性状简化为3个主成分,即叶产量因子、长势因子、叶数因子,提供的信息占全部信息量的95.99%。6对SRAP引物在Florda301×GDH94及其亲本中共扩增出66条带,其中差异条带32条,占48.48%;差异表达类型分为UNF1、ABF1、UNP1、UNP2、DMP、DMP2六种,分别占：19.20%、8.04%、4.60%、5.75%、2.30%、6.90%。从杂种特异表达片段中分离的两条片段分别与GDP-甘露糖4,6-脱水酶和蔗糖6-果糖基转移酶同源。本研究结果为烟草农艺性状杂种优势研究提供基础理论参考。

简介：紫外线B(UV-B)对于植物生长发育具有重要调节作用,其中UVRESISTANCELOCUS8蛋白作为UV-B的光受体在植物响应UV-B过程中起关键作用。草莓是一种重要的经济果树,目前关于草莓的UV-B光受体报道较少。为研究草莓中UV-B受体蛋白,本研究采用同源克隆的方法获得‘丰香’草莓中编码UV-B光受体蛋白的cDNA序列,进行了生物信息学的分析并构建了原核生物表达载体pET32a-UVR8,利用中心点响应面法优化了重组蛋白的诱导条件(包括诱导温度,IPTG浓度,菌液浓度和诱导时间)。结果表明:克隆得到了编码草莓UVR8蛋白的全长cDNA序列,命名为FaUVR8,生物信息学分析表明该序列长1317bp,编码438个氨基酸,预测分子量为47.28kD,等电点pI为5.85,重建蛋白质三维结构表明该蛋白包含7个β-片状螺旋结构;原核表达得到69.7kD的融合蛋白,对四个诱导条件优化表明将工程菌培养至菌液OD600=0.7,加入浓度为0.55mmol/L的IPTG,在27.72℃下诱导9h,可获得最大量重组蛋白79μg/mL。研究结果可为后期寻找与FaUVR8蛋白互作的下游蛋白,以及进一步开展其功能研究提供参考。