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  • 作者: 宋炳辉 郭侃 傅俊江
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2023-03-15
  • 出处:《国际遗传学杂志》 2023年第01期
  • 机构:西南医科大学医学基础研究中心表观遗传与肿瘤四川省高校重点实验室,泸州 646000 西南医科大学医学基础研究中心精准医学与DNA法医学研究室,泸州 646000,西南医科大学医学基础研究中心表观遗传与肿瘤四川省高校重点实验室,泸州 646000 西南医科大学医学基础研究中心精准医学与DNA法医学研究室,泸州 646000 西南医科大学司法鉴定中心DNA法医物证实验室,泸州 6
  • 简介:摘要目前表观遗传学在各个领域展开深入研究,因其不以DNA序列改变为前提的特殊遗传模式,而在法医学中具有很高的应用和研究价值。在表观遗传学中,DNA甲基作为发现最早且研究最多的表观遗传现象,其为解决同卵双生子的鉴别、年龄的推断、组织体液的推断等法医学实践问题提供了新的思路和方法。本文将对法医学中DNA甲基的常用检测方法进行总结和归纳,并对DNA甲基在同卵双生子的鉴别、年龄的推断和组织体液的推断中的研究进展和应用现状进行阐述。以此展示了DNA甲基和法医学的密切联系,并对其在法医学领域中的研究价值和应用前景进行了讨论。

  • 标签: DNA甲基化 法医学 表观遗传学 同卵双生子的鉴别 年龄推断 组织体液推断
  • 简介:摘要N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)甲基作为真核生物中最常见的RNA修饰,通过甲基转移酶、去甲基酶、甲基识别蛋白三种调控因子参与多种细胞进程和疾病进展。近年来的研究表明m6A甲基修饰参与了精子发生的整个过程,其失调造成的生精障碍可能导致男性不育。本文就m6A调控因子在睾丸中的时空表达、m6A甲基在精子发生中的作用机制以及m6A甲基调控异常与男性不育等方面的研究进展作一综述,旨在为男性不育的基础研究和临床治疗提供参考。

  • 标签: 精子发生 N6-甲基腺嘌呤甲基化 不育,男性 表观遗传
  • 作者: 李嘉铃 苏永健 董柏青 吴琪俊 杨庆利 陈钦艳 陈世艺 谭超 居昱 李海
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华预防医学杂志》 2022年第07期
  • 机构:广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室,南宁 530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室,南宁 530200,广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室,南宁 530200,广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室,南宁 530200,广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室,南宁 530028,桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,桂林 541000,广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所,南宁 
  • 简介:摘要目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 mIU/ml设为病例组,≥100 mIU/ml设为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序、使用Illumina平台对IFNG基因目标区域及其CpG位点进行DNA甲基高通量测序。采用非条件logistic回归模型分析IFNG基因18个位点胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸 DNA甲基情况与HepB免疫应答水平的关联。结果病例组(104名)和对照组(159名)抗-HBs[M(Q1,Q3)]分别为62.34(30.06,98.88)mIU/ml和1 089.10(710.35,1 233.45)mIU/ml。病例组IFNG_1基因44和93位点甲基水平差异高于对照组(P<0.05),非条件logistic回归模型显示,IFNG_1基因44位点(OR=1.18,95%CI:1.03~1.35)和93位点(OR=1.21,95%CI:1.07~1.38)DNA甲基水平与HepB应答水平具有相关性。结论IFNG_1基因44和93位点DNA甲基水平改变可能是影响广西汉族儿童HepB应答水平的相关因素。

  • 标签: 乙型肝炎疫苗 DNA甲基化 表观遗传学 免疫应答水平
  • 作者: 焦洁 袁璐璐 李坛 吴辉 谷桂珍 陈国顺 张焕玲 余善法
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《中华预防医学杂志》 2022年第08期
  • 机构:河南省第三人民医院(河南省职业病医院)劳动卫生科,郑州 450052,郑州大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系,郑州 450001,河南省第三人民医院(河南省职业病医院)办公室,郑州 450052,河南省平顶山市舞钢劳动卫生职业病防治研究所体检中心,平顶山 467036,河南医学高等专科学校公共卫生与健康管理学院,郑州 451191
  • 简介:摘要目的探讨DNA甲基与职业性噪声听力损失的关联。方法采用病例对照研究方法,从2006年建立的某钢铁厂噪声作业工人研究队列中,选择职业性噪声暴露听力损失病例为病例组,职业性噪声暴露听力正常人群为对照组。共纳入60例调查对象,其中病例组和对照组各30例。应用850K全基因组DNA甲基芯片技术检测甲基水平,采用R包champ进行差异甲基位点(DMP)的显著性检验,采用R包champ的Bumphunter算法,进行差异甲基区域(DMR)分析。采用clusterProfiler对基因列表进行GO和KEGG通路富集分析。结果两组研究对象在双耳高频平均听阈差异具有统计学意义(P<0.05),在年龄、吸烟情况、饮酒情况、高血压情况、体育锻炼和累积噪声暴露量方面差别均无统计学意义。DMP和DMR分析结果显示,病例组和对照组中检测了713875个位点,差异显著的甲基位点439个,占比0.06%;检测了650个区域,差异显著的甲基区域72个,占比11.08%。GO富集分析结果显示,与对照组相比,病例组在中枢神经系统投射神经元轴突发生、中枢神经系统神经元发育、中枢神经系统神经元轴索发生和中枢神经系统神经元分化4个通路差异具有统计学意义。KEGG富集分析结果显示,与对照组相比,病例组和对照组在鞘脂代谢、醛固酮的合成和分泌、初级胆汁酸生物合成通路差异具有统计学意义。结论职业性噪声听力损失的发生可能与中枢神经系统投射神经元轴突发生、中枢神经系统神经元发育、中枢神经系统神经元轴索发生、中枢神经系统神经元分化、鞘脂代谢、醛固酮的合成和分泌、初级胆汁酸生物合成等通路相关的基因表达调控或代谢有关的基因甲基状态有关。

  • 标签: DNA甲基化 病例对照研究 职业性噪声听力损失
  • 简介:为探索有效分离两样品间差异甲基片段的方法,以DNMT1(DNAmethyltransferase1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基位点分布规律.实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法,能筛选出两样品间的差异甲基片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性.

  • 标签: 消减杂交 DNA甲基化 差异甲基化片段 表观遗传学 CPG岛 DNMT
  • 简介:目的通过检测子宫肌瘤组织与相邻的正常子宫肌层组织的P16基因启动区甲基的状态的差异性,以探讨子宫肌瘤的发病机理;方法对2009年9月至2010年12月在我院就医的60例30-48岁妇女子宫肌瘤患者,采用甲基特异性聚合酶链式反应(Methylation-SpecificPCR,MSP)法检测P16基因启动区域CpG岛异常甲基,可在一定程度上反应该基因失活情况,从肿瘤的分子生物角度研究妇女子宫肌瘤的特点及子宫肌瘤的发病机理;以及采用化学发光法检测雌孕激素受体,子宫肌瘤与雌孕激素受体水平的关系;以及采用统计方法分析数据,探讨P16基因启动区甲基状态变化与雌孕激素受体水平的关系;结果受体阳性细胞的百分数分为4级阴性(一),阳性细胞<25%或不染色;弱阳性(+),阳性细胞25%一50%,阳性染色较清晰;阳性(++)阳性细胞5l%一75%,阳性染色较清晰;强阳性(+++)阳性细胞>76%,细胞核深棕色;结论甲基容纳和免疫组测定了30例子宫肌瘤及其临近肌层组织总体DNA甲基状态,发现与临近肌层相比子宫肌瘤组织呈现总体低甲基,子宫肌瘤对雌、孕激素具有高应答性,且雌激素受体(estrogenreceptor,ER)和孕激素受体(progesteronereceptor,PR)高表达。

  • 标签: P16基因 子宫肌瘤 发生机制
  • 简介:

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  • 简介:目的探讨胰腺癌患者外周血DNA中SARP2基因甲基对胰腺癌的诊断价值。方法收集12例原发性胰腺癌、10例慢性胰腺炎和6例健康志愿者外周静脉血,提取血清游离DNA,经亚硫酸氢盐修饰后,行SARP2基因第一外显子区域的BSP扩增和测序。结果12例胰腺癌外周血DNA、10例慢性胰腺炎外周血DNA中分别有10例(83%)和4例(40%)检测出明显的SARP2基因甲基改变。胰腺癌患者外周血中SARP2基因第一外显子区CpG位点甲基率为16.8%;慢性胰腺炎患者的甲基率为10.4%,健康志愿者为2.2%。3组间的SARP2CpG岛甲基率差别非常显著(P〈0.01或P〈0.05)。结论胰腺癌患者外周血DNA中可以检测到SARP2甲基改变,SARP2甲基的检测对胰腺癌的诊断可能有潜在的临床价值。

  • 标签: 胰腺肿瘤 DNA甲基化 SARP2基因
  • 简介:摘要目的多重耐药(drug resistance,MDR)是肿瘤化疗失败的主要原因。本研究旨在探讨MDR1甲基对宫颈癌经皮子宫动脉血管腔内化疗栓塞疗效的影响。方法选择67例宫颈癌患者接受栓塞化疗,45例正常宫颈组织作为对照。免疫组检测宫颈癌中P-糖蛋白(P-gp)水平,并与正常组织进行比较。通过使用特异性千碱基裂解法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法分析MDR1基因启动子区16个CpG岛的甲基状态。结果P-gp在正常宫颈组织中的阳性表达率为0% (0/45),介入栓塞化疗前后的阳性表达率分别为61.19%(41/67)和77.61%(52/67)。宫颈癌组织与正常宫颈组织相比有明显差异(χ2=4.2523,0.0392)。化疗前P-gp的阳性表达率与化疗疗效呈负相关(r=-0.340,P=0.005)。正常组织中13个CpG岛的甲基率显著高于宫颈组织(P<0.05)。在宫颈癌组织中,经皮子宫动脉血管腔内化疗栓塞前6个CpG岛的甲基率高于化疗后,但1个CpG岛的甲基率低于化疗后(P<0.05)。化疗前有效化疗的1个CpG岛甲基率明显高于无效化疗(P<0.05),其他CpG岛相似(P<0.05)。结论MDR1编码的P-gp表达水平,部分MDR1基因启动子区CpG岛的甲基状态,与宫颈癌介入栓塞化疗的疗效密切相关。

  • 标签: 宫颈癌 经皮子宫动脉血管腔内化疗栓塞 MDR1基因 甲基化 免疫组化
  • 简介:目的检测结肠癌患者外周血清中RUNX3基因启动子区域甲基状态,探讨循环DNARUNX3基因甲基对早期诊断结肠癌及其预后分析的价值。方法采集8例健康志愿者、12例结肠良性病变和52例结肠癌患者的外周血清,以甲基特异性聚合酶链反应(MSP)检测RUNX3基因启动子区域CpG岛甲基状态,并分析其与结肠癌患者临床病理特征之间的关系。结果8例健康志愿者中检出率为0,12例结肠良性病变患者中有2例(16.7%)为不完全甲基,52例结肠癌患者血清RUNX3基因启动子区域异常甲基29例,检出率为55.8%,差异有统计学意义(P〈0.001);且RUNX3基因启动子区域甲基与淋巴结转移及临床分期相关。结论RUNX3基因启动子区域CpG岛异常高频甲基在结肠癌患者外周血清中检出率较高,对结肠癌早期诊断与预后分析提供了新的思路。

  • 标签: 结肠癌 RUNX3甲基化 循环DNA
  • 简介:DNA/miRNA基因甲基作为一种新的结直肠癌非侵入性筛查标志物,被证实具有较高的敏感性和特异性,目前有大量有关检测血液、粪便中DNA/miRNA基因异常甲基筛查结直肠癌的研究,但仅有个别商业甲基基因试剂盒小规模应用于临床实践。本人将对目前有关检测血液/粪便中DNA/miRNA基因异常甲基筛查结直肠癌的国内外研究进行综述,总结其潜在的临床价值。

  • 标签: DNA/miRNA基因 甲基化 结直肠癌 生物标志物 筛查
  • 简介:研究孕妇外周血浆中APC基因甲基模式与孕妇妊娠状态的关系,健康未孕妇女血浆中APC基因是未甲基或低甲基的,妊娠中期和晚期样品检测结果中APC基因的甲基状态有相似的模式

  • 标签: 分析孕妇 初步研究 利用基因芯片
  • 简介:摘要:目的了解健康体检者体内 Septin9基因甲基水平,做好高危人群 Septin9基因甲基检测,达到结直肠癌的早期筛查目的,提高本地区结直肠癌的综合防治水平。方法选自 2018年 2月至 2020年 8月我院体检中心健康体检者 221例,分析 Septin9基因甲基检测结果。结果发现健康体检者 Septin9基因甲基阳性率为 4.9%( 11/221)与文献报道一直。结论在高危人群中推广 Septin9基因甲基检测,提高结直肠癌的早期筛查率,是提高结直肠癌早诊早治、降低结直肠癌死亡率的有效途径。

  • 标签: Septin9基因甲基化 结直肠癌 早期筛查
  • 简介:本研究旨在通过对广西省重型β地中海贫血患者和正常人外周血中γ珠蛋白基因启动子区CpG岛的甲基位点的确认和对各个CpG位点甲基率在重型β地中海贫血患者与正常人之间的差异性分析,初步筛选出可能影响γ珠蛋白表达的主要甲基位点。采用重亚硫酸盐测序法修饰,递降PCR扩增,最后对PCR产物进行DNA克隆测序,得到目的片段中每个CG位点的甲基情况,定量检测甲基的确切位置与程度。结果表明:重型β地中海贫血患者与正常人γ珠蛋白基因启动子区存在4个CpG甲基位点,在序列中分别位于28、122、231和234bp,均呈高度甲基,其中122和231bp位点甲基率明显低于正常对照组,差异均有统计学意义。28和234bp位点甲基率与正常对照组均无显著性差异。结论:证实γ基因启动子区存在甲基位点、明确位点位置且经定量分析证实无论地中海贫血患者还是正常人各个甲基位点均呈高甲基状态;初步筛选出影响γ珠蛋白表达的主要位点可能在122和231bp,为后续通过调节γ珠蛋白的表达缓解重型β地中海贫血的临床症状、靶向基因治疗研究提供了实验依据。

  • 标签: 重型Β地中海贫血 γ珠蛋白基因 基因启动子 DNA甲基化
  • 简介:目的探讨肾母细胞瘤患儿血液中p73基因的转录表达、启动子甲基状态及二者之间关系。方法收集45例肾母细胞瘤患儿为病例组,以健康体检或因其他原因就诊的性别、年龄匹配的15例(排除肿瘤等恶性疾病)儿童为对照组。采集两组儿童外周血,运用实时荧光定量PCR(qRT—PCR)和甲基特异性PCR(USP)法检测p73基因转录表达水平及其启动子甲基状态,并分析病例组中p73基因的表达及甲基与临床资料的关系,及p73基因的甲基对其转录表达的影响。结果病例组中p73mRNA的相对表达量(3.2±0.9)高于对照组(1.6±1.1),差异有统计学意义(P〈0.01);病例组p73基因甲基阳性率(20%)低于对照组(73%),差异有统计学意义(P〈0.01)。病例组中甲基p73mRNA的相对表达量大于非甲基p73mRNA的相对表达量(P〈0.01),且大于对照组中甲基p73mRNA的相对表达量(P〈0.01);非甲基p73mRNA的相对表达量在两组间差异无统计学意义(P=0.810)。结论。肾母细胞瘤外周血中p73基因启动子的异常甲基是其基因表达调节方式之一,并与肾母细胞瘤的发生发展有关;发生甲基的p73基因在肾母细胞瘤中有可能充当癌基因的角色,转录水平的过度表达与其甲基状态有关

  • 标签: P73 肾母细胞瘤 外周血 启动子甲基化 转录表达 儿童
  • 简介:涎腺肿瘤是口腔颌面部常见的一类肿瘤,该类肿瘤结构复杂,组织学形态与生物学行为变异较大,目前治疗仍以手术为主。但除良性肿瘤及部分低度恶性肿瘤手术治疗效果较好外,大多数涎腺恶性肿瘤因缺乏特异性治疗手段,术后常出现复发、转移。近年来,表观遗传学逐渐成为肿瘤研究的热点,DNA甲基作为表观遗传学的重要组成部分,对其认识和研究也在不断深入。本文旨在探讨DNA启动子甲基在涎腺肿瘤的发生、治疗和预后预测中的作用。

  • 标签: 涎腺肿瘤 表观遗传学 DNA甲基化 转化医学
  • 简介:摘要目的探讨粪便DNA甲基标志物检测用于胃癌筛查的可行性以及与胃癌患者临床特征的关系。方法前瞻性收集2018年8月至2019年12月在苏州大学附属第一医院普通外科及消化内科就诊的胃癌患者及胃镜检查阴性者的粪便样本共156份,同时收集胃癌患者术前及术后的临床资料。按照1∶2的比例将这些样本随机分成训练集(n=52)和测试集(n=104)。提取粪便中的DNA,然后检测Syndecan-2黏结蛋白聚糖2基因(SDC2)、分泌性卷曲蛋白2基因(SFRP2)、Ras相关区域家族2基因(RASSF2)、端粒酶逆转录酶基因(TERT)甲基水平,同时用免疫胶体金法检测粪便中血红蛋白(Hb)含量。使用单项粪便DNA标志物的Ct(Cycle threshold荧光信号到达设定阈值时所经历的循环次数)值建立logistic 回归模型,分析单个标志物检测胃癌的灵敏度和特异度;基于Akaike信息准则(AIC),使用多因素逻辑回归及逐步回归分析筛选最优的标志物组合,并在测试集中评价胃癌早期筛查标志物组合筛查/检测胃癌的效果。结果各标志物区分胃癌和阴性对照的准确度排序为:SDC2甲基(71.2%)>TERT甲基(67.3%)=RASSF2甲基(67.3%)>Hb(63.5%)>SFRP2甲基(61.5%)。通过逐步回归分析,在训练集中筛选出一个由SDC2甲基、TERT 甲基和Hb组成的粪便生物标志物组合,在训练集及测试集中检测胃癌的总灵敏度为 66.7%,总特异度为 78.9%。在不同分期以及不同部位胃癌样本中,该标志物组合对Ⅰ期胃癌及胃体部胃癌的灵敏度(分别为78.6%、75.0%)最高。结论粪便中SDC2、SFRP2、TERT、RASSF2基因甲基标志物在胃癌筛查中具有一定的灵敏度和较高的特异度,是胃癌早期筛查中的潜在粪便生物标志物。

  • 标签: 胃肿瘤 早期筛查 粪便生物标志物 DNA甲基化
  • 简介:据2012年9月30日RothbartSB(NatStructMolBiol,2012Sep30.doi.10.1038/nsmb.2390)报道,美国北卡罗来纳大学医学院的研究人员建立起人类两个最为基本性的表观遗传标记——组蛋白修饰和DNA甲基——之间存在的首个关联。在过去20年,科学家们已经理解到DNA内拥有的遗传密码只代表生命蓝图的一部分。

  • 标签: DNA甲基化 组蛋白修饰 遗传标记 研究人员 遗传密码 SEP
  • 简介:此次研究在12例肾癌组织中同样发现RASSF1A和BLU一定频率的高甲基改变,1例膀胱癌癌周正常组织发现RASSF1A启动子高甲基,膀胱癌肾癌RASSF1ABLU高甲基

  • 标签: 中甲基化 甲基化状态 肾癌中